Молекулярно-эпидемиологический анализ рифампицин устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на территории Кыргызской Республики
https://doi.org/10.18093/0869-0189-2006-2-48-52
Аннотация
Для разных стран характерна разная частота встречаемости отдельных мутаций гена rpoB Mycobacterium tuberculosis (MBT). Учитывая регионально-географические особенности распространения мутаций в гене rpoB, обуславливающих резистентность к рифампицину, мы
изучили спектр мутаций гена rpoB микобактерий туберкулеза (МБТ), циркулирующих на территории Кыргызской республики (КР).
Исследовано 605 образцов ДНК МБТ, выделенных от больных туберкулезом, проживающих в восьми регионах КР. Устойчивость МБТ
к рифампицину идентифицировали методом биологических микрочипов. Методом биологических микрочипов выявлено 380 (62,8 %)
чувствительных и 225 (37,2 %) рифампицин устойчивых штаммов МБТ. Среди проанализированных рифампицин устойчивых штаммов
МБТ нам удалось выявить 18 различных типов мутаций, локализованных в 8 кодонах гена rpoB. При этом мутации в 531-м и 526-м кодонах встречались наиболее часто и обуславливали устойчивость к рифампицину в 80 % случаев. Среди всех рифампицин устойчивых
штаммов у 137 из 225 (60,8 %) образцов обнаружена мутация в 531-м кодоне, при этом Ser531®Leu идентифицирована в 59,4 % (134 из
225) случаев. Вторым по частоте встречаемости является мутация в 526-м кодоне 19,1 % (43 из 225). В 526-м кодоне выявлено 5 различных типов мутаций: в том числе His526®Tyr - 4,9 %; His526®Asp - 4,9 %; His526®Arg - 4 %; His526®Leu - 3,5 %; His526®Pro - 1,8 %.
Третьими по частоте встречаемости являются мутации в 516-м и 511-м кодонах. В 516-м кодоне выявлено Asp516®Tyr - 4,4 % и
Asp516®Val - 0,8 % случаев. В 511-м кодоне основной мутацией является Leu511®Pro - 6,3 %. Мутации в 533, 522, 513, 512-м кодонах
встречались редко. Частота встречаемости каждой из мутаций в 533, 522, 513-м кодонах среди всех рифампицин устойчивых штаммов
составила всего 1,8 %, а мутация в 512-м кодоне встречалась в 1,4 % случаев.
изучили спектр мутаций гена rpoB микобактерий туберкулеза (МБТ), циркулирующих на территории Кыргызской республики (КР).
Исследовано 605 образцов ДНК МБТ, выделенных от больных туберкулезом, проживающих в восьми регионах КР. Устойчивость МБТ
к рифампицину идентифицировали методом биологических микрочипов. Методом биологических микрочипов выявлено 380 (62,8 %)
чувствительных и 225 (37,2 %) рифампицин устойчивых штаммов МБТ. Среди проанализированных рифампицин устойчивых штаммов
МБТ нам удалось выявить 18 различных типов мутаций, локализованных в 8 кодонах гена rpoB. При этом мутации в 531-м и 526-м кодонах встречались наиболее часто и обуславливали устойчивость к рифампицину в 80 % случаев. Среди всех рифампицин устойчивых
штаммов у 137 из 225 (60,8 %) образцов обнаружена мутация в 531-м кодоне, при этом Ser531®Leu идентифицирована в 59,4 % (134 из
225) случаев. Вторым по частоте встречаемости является мутация в 526-м кодоне 19,1 % (43 из 225). В 526-м кодоне выявлено 5 различных типов мутаций: в том числе His526®Tyr - 4,9 %; His526®Asp - 4,9 %; His526®Arg - 4 %; His526®Leu - 3,5 %; His526®Pro - 1,8 %.
Третьими по частоте встречаемости являются мутации в 516-м и 511-м кодонах. В 516-м кодоне выявлено Asp516®Tyr - 4,4 % и
Asp516®Val - 0,8 % случаев. В 511-м кодоне основной мутацией является Leu511®Pro - 6,3 %. Мутации в 533, 522, 513, 512-м кодонах
встречались редко. Частота встречаемости каждой из мутаций в 533, 522, 513-м кодонах среди всех рифампицин устойчивых штаммов
составила всего 1,8 %, а мутация в 512-м кодоне встречалась в 1,4 % случаев.
Об авторах
Ж.Т. ИсаковаРоссия
J. Friedland
Россия
А.Ш. Алишеров
Россия
Т.Ч. Чубаков
Россия
Д.К. Кожомкулов
Россия
М.Д. Кожомкулов
Россия
А.Ф. Тумашова
Россия
З.А. Гончарова
Россия
Э.У. Юсупова
Россия
О.А. Пак
Россия
А.А. Алдашев
Россия
Список литературы
1. Gillespie S.H. Evolution of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis: Clinical and molecular perspective. Antimicrob. Agents Chemother. 2002; 46 (2): 267-274.
2. Ramaswamy S., Musser J.M. Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis. Tubercle Lung Dis. 1998; 79 (1): 3-29.
3. Bodmer T., Zurcher G., Imboden P. et al. Mutation position and type of substitution in the B subunit of the RNA polymerase influence in vitro activity of rifamycins in rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis. J. Antimicrob. Chemother. 1995; 35: 345-348.
4. Михайлович В.М., Лапа С.А., Грядунов Д.А. и др. Использование методов гибридизации и ПЦР на специализированном ТБ-микрочипе для обнаружения рифампицин резистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis. Бюл. экспер. биол. 2001; 1: 112-117.
5. Drobnienski F.A., Wilson S.M. The rapid diagnosis of isoniazid and rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis - a molecular story. J. Med. Microbiol. 1998;47: 189-196.
6. Скотникова О.И., Михайлович В.М., Носова Е.Ю. и др. Новые технологии определения лекарственной чувствительности Mycobacterium Tuberculosis. Пробл. туб. 2004; 6: 40-43.
7. Генерозов Э.В., Альтшулер М.Л., Говорун В.М. и др. Детекция и характеристика мутаций в гене rpoВ резистентных к рифампицину клинических штаммов M. tuberculosis. Бюл. экспер. биол. 1999; 2: 39-42.
8. Tracevska T., Jansone I., Broka L. et al. Mutations in the rpoB and katG genes leading to drug resistance in Mycobacterium tuberculosis in Latvia. J.Clin. Microbiol. 2002; 40 (12): 3789-3792.
9. Valim A.M., Rossettu M.R., Ribeiro M.O. et al. Mutations in the rpoB gene of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from Brazil. J. Clin. Microbiol. 2000; 38 (8): 3119-3122.
10. Qian L., Abe C., Lin T. et al. rpoB genotypes of Mycobacterium tuberculosis beijing family isolates from East Asian countries. J. Clin. Microbiol. 2002; 40 (3): 1091-1094.
11. Kapur V., Li L.L., Iordanescu S. et al. Characterization by automated DNA sequencing of mutation in the gene (rpoB) encoding the RNA polymerase B subunit in rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from New York City and Texas. J. Clin. Microbiol. 1994; 32: 1095-1098.
12. Bartfai Z., Soomoskovi A., Kodmon C. et al. Molecular characterization of rifampin-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis from Hungary by DNA sequencing and the line probe Assay. J.Clin. Microbiol. 2001; 39 (10): 3736-3739.
13. Matsiota/Bernard P., Vrioni G., Marinis E. Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant clinical Mycobac terium tuberculosis isolates from Greece. J. Clin. Microbiol. 1998; 36 (1): 20-23.
14. Иманалиев М.Д., Гончарова З.К. Туберкулез в пенитенциарных учреждения Кыргызской Республики. В кн.: Туберкулез: Научные труды и материалы Международной конф. "Контроль над туберкулезом в странах Центрально-Азиатского региона", Чолпон-Ата, 22-25 мая 2003 г. Бишкек; 2003. 38-42.
15. Taniguchu H., Aramaki H., Nikaido Y. et al. Rifampicin resistance and mutation of the rpoB gene in Mycobacterium tuberculosis. FEMS Microbiol. Lett. 1996; 144: 103-108.
Рецензия
Для цитирования:
Исакова Ж., Friedland J., Алишеров А., Чубаков Т., Кожомкулов Д., Кожомкулов М., Тумашова А., Гончарова З., Юсупова Э., Пак О., Алдашев А. Молекулярно-эпидемиологический анализ рифампицин устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на территории Кыргызской Республики . Пульмонология. 2006;(2):48-52. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2006-2-48-52
Просмотров:
179
Послать статью по эл. почте 