Preview

Пульмонология

Расширенный поиск

Микрофлора легких: норма, патологии, влияние вакцинации

https://doi.org/10.18093/0869-0189-2022-4144

Полный текст:

Аннотация

Разработка новых методов диагностики инфекционных заболеваний, таких как полимеразная цепная реакция, секвенирование и массспектрометрия, позволила расширить представление о микрофлоре различных локусов организма человека в целом и респираторного тракта в частности. В легких наиболее распространены представители Proteobacteria (Pseudomonas spp., Haemophilus spp.), Bacteriodetes (Prevotella spp., Porphyromonas spp.) и Firmicutes (Veillonella spp., Streptococcus spp.). Формирование патологического процесса в нижних дыхательных путях приводит к изменению их микробиома. Так, у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких обнаруживаются микроорганизмы родов Moraxella, Haemophilus и Acinetobacter. К основным возбудителям внебольничной пневмонии (ВП) относятся Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Haemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae и другие энтеробактерии. Атипичные возбудители пневмонии представлены Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae и Legionella pneumophila. Широкая распространенность S. pneumoniae в популяции подтверждает необходимость применения вакцин для профилактики развития инвазивных и неинвазивных форм инфекции. Целью исследования явился анализ данных литературы о структуре нормальной микрофлоры легких и изучение ее роли в развитии патологических состояний. Заключение. Все больше исследований подтверждают важную роль нормальной микрофлоры дыхательных путей. Применение вакцинации для профилактики болезней бронхолегочной системы позволяет снизить заболеваемость и смертность от пневмонии. Однако проблема ВП не теряет своей актуальности, в частности, представляет большой интерес динамика изменений структуры возбудителей этого заболевания. Проведение вакцинопрофилактики против респираторных патогенов в совокупности с бесконтрольным приемом антибактериальных препаратов во время пандемии новой коронавирусной инфекции могли способствовать изменению как структуры микрофлоры нижних дыхательных путей в целом, так и возбудителей бактериальной ВП в частности. Выявление изменения доминирующего возбудителя влечет за собой необходимость пересмотра этиотропного лечения и организации плановой профилактики при наличии соответствующих вакцин.

Об авторах

М. О. Золотов
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Самарский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Золотов Максим Олегович – к. м. н., ассистент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

тел.: (846) 374-10-04, доб. 457

443099, Самара, ул. Чапаевская, 89


Конфликт интересов:

Конфликт интересов авторами не заявлен.



А. В. Жестков
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Самарский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Жестков Александр Викторович – д. м. н., профессор, заведующий кафедрой общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

тел.: (846) 374-10-04, доб. 457

443099, Самара, ул. Чапаевская, 89


Конфликт интересов:

Конфликт интересов авторами не заявлен.



А. В. Лямин
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Самарский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Лямин Артем Викторович – д. м. н., профессор кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

тел.: (846) 374-10-04, доб. 457

443099, Самара, ул. Чапаевская, 89


Конфликт интересов:

Конфликт интересов авторами не заявлен.



В. Д. Федотов
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Приволжский исследовательский медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации; Федеральное бюджетное учреждение науки «Нижегородский научно-исследовательский институт гигиены и профпатологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Россия

Федотов Василий Дмитриевич – к. м. н., доцент кафедры госпитальной терапии имени В.Г.Вогралика Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Приволжский исследовательский медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, старший научный сотрудник клинического отдела Федерального бюджетного учреждения науки «Нижегородский научно-исследовательский институт гигиены и профпатологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; главный внештатный пульмонолог министерства здравоохранения Нижегородской области

тел.: (831) 419-61-94

603005, Нижний Новгород, пл. Минина и Пожарского, 10/1
603105, Нижний Новгород, ул. Семашко, 20


Конфликт интересов:

Конфликт интересов авторами не заявлен.



Список литературы

1. Segal L.N., Alekseyenko A.V., Clemente J.C. et al. Enrichment of lung microbiome with supraglottic taxa is associated with increased pulmonary inflammation. Microbiome. 2013; 1 (1): 19. DOI: 10.1186/2049-2618-1-19.

2. Man W.H., de Steenhuijsen Piters W.A., Bogaert D. The microbiota of the respiratory tract: gatekeeper to respiratory health. Nat. Rev. Microbiol. 2017; 15 (5): 259–270. DOI: 10.1038/nrmicro.2017.14.

3. Moffatt M.F., Cookson W.O. The lung microbiome in health and disease. Clin. Med. (Lond.). 2017; 17 (6): 525–529. DOI: 10.7861/clinmedicine.17-6-525.

4. Charlson E.S., Bittinger K., Chen J. et al. Assessing bacterial populations in the lung by replicate analysis of samples from the upper and lower respiratory tracts. PLoS One. 2012; 7 (9): e42786. DOI: 10.1371/journal.pone.0042786.

5. Charlson E.S., Bittinger K., Haas A.R. et al. Topographical continuity of bacterial populations in the healthy human respiratory tract. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2011; 184 (8): 957–963. DOI: 10.1164/rccm.201104-0655OC.

6. Bassis C.M., Erb-Downward J.R., Dickson R.P. et al. Analysis of the upper respiratory tract microbiotas as the source of the lung and gastric microbiotas in healthy individuals. mBio. 2015; 6 (2): e00037. DOI: 10.1128/mBio.00037-15.

7. Huffnagle G.B., Dickson R.P., Lukacs N.W. The respiratory tract microbiome and lung inflammation: a two-way street. Mucosal Immunol. 2017; 10 (2): 299–306. DOI: 10.1038/mi.2016.108.

8. Brunworth J.D., Garg R., Mahboubi H. et al. Detecting nasopharyngeal reflux: a novel pH probe technique. Ann. Otol. Rhinol. Laryngol. 2012; 121 (7): 427–430. DOI: 10.1177/000348941212100701.

9. Keck T., Lindemann J. Numerical simulation and nasal air-conditioning. GMS Curr. Top. Otorhinolaryngol. Head Neck Surg. 2010; 9: Doc08. DOI: 10.3205/cto000072.

10. Hatch T.F. Distribution and deposition of inhaled particles in respiratory tract. Bacteriol. Rev. 1961; 25 (3): 237–240. DOI: 10.1128/br.25.3.237-240.1961.

11. Ubags N.D.J., Marsland B.J. Mechanistic insight into the function of the microbiome in lung diseases. Eur. Respir. J. 2017; 50 (3): 1602467. DOI: 10.1183/13993003.02467-2016.

12. Segal L.N., Rom W.N., Weiden M.D. Lung microbiome for clinicians. New discoveries about bugs in healthy and diseased lungs. Ann. Am. Thorac. Soc. 2014; 11 (1): 108–116. DOI: 10.1513/AnnalsATS.201310-339FR.

13. Fujimura K.E., Demoor T., Rauch M. et al. House dust exposure mediates gut microbiome Lactobacillus enrichment and airway immune defense against allergens and virus infection. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2014; 111 (2): 805–810. DOI: 10.1073/pnas.1310750111.

14. Wang J., Li F., Wei H. et al. Respiratory influenza virus infection induces intestinal immune injury via microbiota-mediated Th17 cell-dependent inflammation. J. Exp. Med. 2014; 211 (12): 2397–2410. DOI: 10.1084/jem.20140625.

15. Wu B.G., Sulaiman I., Tsay J.J. et al. Episodic aspiration with oral commensals Induces a MyD88-dependent, pulmonary T-helper cell type 17 response that mitigates susceptibility to Streptococcus pneumoniae. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2021; 203 (9): 1099–1111. DOI: 10.1164/rccm.202005-1596OC.

16. Nembrini C., Sichelstiel A., Kisielow J. et al. Bacterial-induced protection against allergic inflammation through a multicomponent immunoregulatory mechanism. Thorax. 2011; 66 (9): 755–763. DOI: 10.1136/thx.2010.152512.

17. Ege M.J., Mayer M., Normand A.C. et al. Exposure to environmental microorganisms and childhood asthma. N. Engl. J. Med. 2011; 364 (8): 701–709. DOI: 10.1056/NEJMoa1007302.

18. Ege M.J., Bieli C., Frei R. et al. Prenatal farm exposure is related to the expression of receptors of the innate immunity and to atopic sensitization in school-age children. J. Allergy Clin. Immunol. 2006; 117 (4): 817–823. DOI: 10.1016/j.jaci.2005.12.1307.

19. Roduit C., Wohlgensinger J., Frei R. et al. Prenatal animal contact and gene expression of innate immunity receptors at birth are associated with atopic dermatitis. J. Allergy Clin. Immunol. 2011; 127 (1): 179–185. DOI: 10.1016/j.jaci.2010.10.010.

20. Marsland B.J., Trompette A., Gollwitzer E.S. The gut–lung axis in respiratory disease. Ann. Am. Thorac. Soc. 2015; 12 (Suppl. 2): S150–156. DOI: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.

21. McKenzie A.N. Type-2 innate lymphoid cells in asthma and allergy. Ann. Am. Thorac. Soc. 2014; 11 (Suppl. 5): S263–270. DOI: 10.1513/annalsats.201403-097aw.

22. Molyneaux P.L., Mallia P., Cox M.J. et al. Outgrowth of the bacterial airway microbiome after rhinovirus exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2013; 188 (10): 1224–1231. DOI: 10.1164/rccm.201302-0341OC.

23. Lynch S.V., Bruce K.D. The cystic fibrosis airway microbiome. Cold Spring Harb. Perspect. Med. 2013; 3 (3): a009738. DOI: 10.1101/cshperspect.a009738.

24. Prevaes S.M., de Steenhuijsen Piters W.A., de Winter-de Groot K.M. et al. Concordance between upper and lower airway microbiota in infants with cystic fibrosis. Eur. Respir. J. 2017; 49 (3):1602235. DOI: 10.1183/13993003.02235-2016.

25. Coburn B., Wang P.W., Diaz Caballero J. et al. Lung microbiota across age and disease stage in cystic fibrosis. Sci. Rep. 2015; 5: 10241. DOI: 10.1038/srep10241.

26. Huffnagle G.B., Dickson R.P. The bacterial microbiota in inflammatory lung diseases. Clin. Immunol. 2015; 159 (2): 177–182. DOI: 10.1016/j.clim.2015.05.022.

27. Dickson R.P., Erb-Downward J.R., Huffnagle G.B. Towards an ecology of the lung: new conceptual models of pulmonary microbiology and pneumonia pathogenesis. Lancet Respir. Med. 2014; 2 (3): 238–246. DOI: 10.1016/S2213-2600(14)70028-1.

28. Angus D.C., van der Poll T. Severe sepsis and septic shock. N. Engl. J. Med. 2013; 369 (9): 840–851. DOI: 10.1056/NEJMra1208623.

29. Flume P.A., Chalmers J.D., Olivier K.N. Advances in bronchiectasis: endotyping, genetics, microbiome, and disease heterogeneity. Lancet. 2018; 392 (10150): 880–890. DOI: 10.1016/S0140-6736(18)31767-7.

30. Aksamit T.R., O’Donnell A.E., Barker A. et al. Adult patients with bronchiectasis: a first look at the US bronchiectasis research registry. Chest. 2017; 151 (5): 982–992. DOI: 10.1016/j.chest.2016.10.055.

31. Ferreira-Coimbra J., Sarda C., Rello J. Burden of community-acquired pneumonia and unmet clinical needs. Adv. Ther. 2020; 37 (4): 1302–1318. DOI: 10.1007/s12325-020-01248-7.

32. Kolditz M., Ewig S. Community-acquired pneumonia in adults. Dtsch. Arztebl. Int. 2017; 114 (49): 838–848. DOI: 10.3238/arztebl.2017.0838.

33. Невзорова В.А., Туркутюков В.Б., Мартыненко И.М. и др. Микробиологические аспекты диагностики внебольничной пневмонии. Бюллетень физиологии и патологии дыхания. 2004; (18): 15–17. Доступно на: https://cyberleninka.ru/article/n/mikrobiologicheskie-aspekty-diagnostiki-vnebolnichnoy-pnevmonii/viewer/.

34. Бруснигина Н.Ф., Мазепа В.Н., Самохина Л.П. и др. Этиологическая структура внебольничной пневмонии. Медицинский альманах. 2009; 7 (2): 118–121. Доступно на: https://cyberleninka.ru/article/n/etiologicheskaya-struktura-vnebolnichnoy-pnevmonii?ysclid=l9zd81fvx139158914.

35. Чучалин А.Г., Синопальников А.И., Козлов Р.С. и др. Российское респираторное общество (РРО), Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ). Клинические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике тяжелой внебольничной пневмонии у взрослых. Пульмонология. 2014; (4): 13–48. DOI: 10.18093/0869-0189-2014-0-4-13-48.

36. Куликов П.В., Жоголев С.Д., Аминев Р.М. и др. Эпидемиологическая и этиологическая характеристика внебольничной пневмонии у военнослужащих по призыву в современный период. Сравнительная оценка эффективности пневмококковых вакцин. Журнал инфектологии. 2019; 11 (2): 116–123. DOI: 10.22625/2072-6732-2019-11-2-116-123.

37. Авдеев С.Н., Дехнич А.В., Зайцев А.А. и др. Внебольничная пневмония: федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению. Пульмонология. 2022; 32 (3): 295–355. DOI: 10.18093/0869-0189-2022-32-3-295-355.

38. Герасимова А.С., Челбаева Е.А., Тарасеева Г.Н., Олейников В.Э. Структура бактериальных возбудителей и рациональная фармакотерапия внебольничной пневмонии. Известия высших учебных заведений. Поволжский регион. Медицинские науки. 2016; 40 (4): 40–50. DOI: 10.21685/2072-3032-2016-4-5.

39. Баранов А.А., Намазова-Баранова Л.С., Брико Н.И. и др. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции у детей. Педиатрическая фармакология. 2018; 15 (3): 200–211. DOI: 10.15690/pf.v15i3.1899.

40. French N., Gordon S.B., Mwalukomo T. et al. A trial of a 7-valent pneumococcal conjugate vaccine in HIV-infected adults. N. Engl. J. Med. 2010; 362 (9): 812–822. DOI: 10.1056/NEJMoa0903029.

41. Pollard A.J., Perrett K.P., Beverley P.C. Maintaining protection against invasive bacteria with protein polysaccharide conjugate vaccines. Nat. Rev. Immunol. 2009; 9 (3): 213–220. DOI: 10.1038/nri2494.

42. Theilacker C., Fletcher M.A., Jodar L., Gessner B.D. PCV13 vaccination of adults against pneumococcal disease: what we have learned from the community-acquired pneumonia immunization trial in adults (CAPiTA). Microorganisms. 2022; 10 (1): 127. DOI: 10.3390/microorganisms10010127.

43. Feldman C., Anderson R. Recent advances in the epidemiology and prevention of Streptococcus pneumonia infections. F1000Res. 2020; 9 (F1000 Faculty Rev.): 338. DOI: 10.12688/f1000research.22341.1.

44. Костинов М.П., Протасов А.Д., Жестков А.В. и др. Влияние разных схем вакцинации против пневмококковой инфекции на клиническое течение хронической обструктивной болезни легких: фокус на изменении микробиоценоза мокроты. Туберкулез и болезни легких. 2021; 99 (7): 7–17. DOI: 10.21292/2075-1230-2021-99-7-7-17.

45. Харит С. М., Фридман И. В., Павлюкова А. Н. и др. Клиническая эффективность пневмококковой конъюгированной 13-валентной вакцины у детей раннего возраста. Педиатрическая фармакология. 2016; 13 (5): 443–447. DOI: 10.15690/pf.v13i5.1639.

46. Чучалин А.Г., Брико Н.И., Авдеев С.Н. и др. Федеральные клинические рекомендации по вакцинопрофилактике пневмококковой инфекции у взрослых. Пульмонология. 2019; 29 (1): 19–34. DOI: 10.18093/0869-0189-2019-29-1-19-34.

47. Брико Н.И., Фельдблюм И.В., Бикмиева А.В. и др. Вакцинопрофилактика взрослого населения против пневмококковой инфекции. Антибиотики и химиотерапия. 2019; 64 (1-2): 37–43. DOI: 10.24411/0235W2990W2019W10007.


Дополнительные файлы

Рецензия

Для цитирования:


Золотов М.О., Жестков А.В., Лямин А.В., Федотов В.Д. Микрофлора легких: норма, патологии, влияние вакцинации. Пульмонология. 2022;. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2022-4144

For citation:


Zolotov M.O., Zhestkov A.V., Lyamin A.V., Fedotov V.D. Microflora of the lungs in health and disease, the impact of vaccination. PULMONOLOGIYA. 2022;. (In Russ.) https://doi.org/10.18093/0869-0189-2022-4144

Просмотров: 32


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International.


ISSN 0869-0189 (Print)
ISSN 2541-9617 (Online)