Определение лекарственной устойчивости и генотипирование клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis при помощи экспериментального набора "ТБ-ТЕСТ"


https://doi.org/10.18093/0869-0189-2013-0-4-77-81

Полный текст:


Аннотация

Резюме. Проведен анализ лекарственной устойчивости 266 образцов геномной ДНК Mycobacterium tuberculosis с использованием экспериментального набора "ТБ-ТЕСТ". Этот метод основан на применении технологии олигонуклеотидных биочипов и позволяет определять наиболее распространенные в России генотипы патогена, а также мутации, ответственные за формирование резистентности к основным препаратам, применяемым для лечения туберкулеза, – рифампицину, изониазиду, этамбутолу, фторхинолонам, аминогликозидам и капреомицину. В результате были получены профили резистентности и определены генотипы для всех образцов. Тестируемый метод показал хорошую корреляцию результатов с данными классических микробиологических тестов. Разработанная система "ТБ-ТЕСТ" является приоритетной для использования в клинической лабораторной диагностике.


Об авторах

Ю. А. Беспятых
НИИ физико-химической медицины ФМБА России
Россия

м. н. с. лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов 

119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а. Тел.: 8 (909) 961-18-46.



Е. А. Шитиков
НИИ физико-химической медицины ФМБА России
Россия

науч. сотр. лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов 

119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а. Тел.: 8 (916) 835-24-32.



Д. В. Зименков
ФГБУН "Институт молекулярной биологии им. Энгельгардта" РАН
Россия

к. б. н., науч. сотр. лаборатории биологических микрочипов 

119991, Москва, ул. Вавилова, 32. Тел.: (499) 135-98-46.



Е. В. Кулагина
ФГБУН "Институт молекулярной биологии им. Энгельгардта" РАН
Россия

науч. сотр. лаборатории биологических микрочипов 

119991, Москва, ул. Вавилова, 32. Тел.: (499) 135-98-46.



Д. А. Грядунов
ФГБУН "Институт молекулярной биологии им. Энгельгардта" РАН
Россия

к. б. н., ведущий научный сотрудник лаборатории биологических микрочипов 

119991, Москва, ул. Вавилова, 32. Тел.: (499) 135-98-46.



Е. Ю. Носова
Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом
Россия

к. м. н., науч. сотр. 

107014, Москва, ул. Стромынка, 10. Тел.: (499) 268-01-31.



А. А. Букатина
Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом
Россия

науч. сотр. 

107014, Москва, ул. Стромынка, 10. Тел.: (499) 268-01-31.



М. В. Шульгина
НИИ фтизиопульмонологии
Россия

д. б. н., руководитель лаборатории этиологической диагностики

191036, Санкт-Петербург, Лиговский пр., 2–4. Тел.: (812) 579-24-21.



В. Ю. Журавлев
НИИ фтизиопульмонологии
Россия

к. м. н., в. н. с. лаборатории этиологической диагностики 

191036, Санкт-Петербург, Лиговский пр., 2–4. Тел.: (812) 579-24-21.



Е. Н. Ильина
НИИ физико-химической медицины ФМБА России
Россия

д. б. н., зав. лабораторией молекулярной генетики микроорганизмов 

119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а. Тел.: (499) 245-04-70.



Список литературы

1. Бюллетень ВОЗ. Европейское региональное бюро ВОЗ; 2012: 90. http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/83803/1/9789244505113-rus.pdf

2. CDC. Notice to readers: Revised Definition of extensively drug-resistant tuberc. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2006; 55 (43): 1176.

3. Zignol M., Hosseini M. S., Wright A. et al. Global incidence of multidrug-resistant tuberculosis. Infect. Dis. 2006; 194: 479–485.

4. Нарвская О.В., Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф. и др. Генетическое маркирование полирезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на Северо-Западе России. Пробл. туб. 1999; 3: 39–41.

5. Нарвская О.В. Геномный полиморфизм Mycobacterium tuberculosis и его роль в эпидемическом процессе: Автореф. дис. … д-ра мед. наук. СПб.; 2003.

6. Toungoussova O., Sandven P., Mariandyshev A. et al. Spread of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing genotype in the Archangel Oblast, Russia. J. Clin. Microbiol 2002; 40: 1930–1937.

7. Вишневский Б.И., Нарвская О.В., Васильева С.Н. и др. Вирулентность микобактерий туберкулеза. Пробл. туб. 2002; 10: 33–36.

8. Черноусова Л.Н., Андреевская С.Н., Смирнова Т.Г. и др. Биологические свойства штаммов M. tuberculosis кластера W. Пробл. туб. и бол. легких 2008; 10: 45–50.

9. Lopez B., Aguilar D., Orozco H. et al. A marked difference in pathogenesis and immune response induced by different Mycobacterium tuberculosis genotypes. Clin. Exp. Immunol. 2003; 133: 37.

10. Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A. et al. Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype in Russia: in Search of Informative Variable-Number Tandem-Repeat Loci. J Clin Microbiol 2008; 46: 3576–3584.

11. Kruuner A., Hoffner S. E., Sillastu H. et al. Spread of drugresistant pulmonary tuberculosis in Estonia. J. Clin. Microbiol. 2001; 39: 3339–3345.

12. Gryadunov D., Dementieva E., Mikhailovich V. et al. Gelbased microarrays in clinical diagnostics in Russia. Exp. Rev. Mol. Diagn. 2011; 11 (8): 839–853

13. Gryadunov D., Mikhailovich V., Lapa S. et al. Evaluation of hybridisation on oligonucleotide microarrays for analysis of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. Clin. Microbiol. Infect. 2005; 11: 531–539.

14. Zimenkov D.V., Antonova O.V., Kuz'min A.V. et al. Detection of second-line drug resistance in Mycobacterium tuberculosis using oligonucleotide microarrays. BMC Infect. Dis. 2013; 13: 240.

15. Mokrousov I., Otten T., Vyshnevskiy B. et al. Detection of embB306 mutations in ethambutol-susceptible clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from northwestern Russia: implications for genotypic resistance testing. J. Clin. Microbiol. 2002; 40: 3810–3813.

16. Hazbon M.H., Bobadilla del Valle M., Guerrero M.I. et al. Role of embB codon 306 mutations in Mycobacterium tuberculosis revisited: a novel association with broad drug resistance and IS6110 clustering rather than ethambutol resistance. Antimicrob. Agents Chemother. 2005; 49: 3794–3802.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Беспятых Ю.А., Шитиков Е.А., Зименков Д.В., Кулагина Е.В., Грядунов Д.А., Носова Е.Ю., Букатина А.А., Шульгина М.В., Журавлев В.Ю., Ильина Е.Н. Определение лекарственной устойчивости и генотипирование клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis при помощи экспериментального набора "ТБ-ТЕСТ".  Пульмонология. 2013;(4):77-81. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2013-0-4-77-81

For citation: Bespyatykh Y.A., Shitikov E.A., Zimenkov D.V., Kulagina E.V., Gryadunov D.A., Nosova E.Y., Bukatina А.А., Shulgina M.V., Zhuravlev V.Y., Ilyina E.N. Identification of drug resistance and genotyping of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis using the TB-TEST. Russian Pulmonology. 2013;(4):77-81. (In Russ.) https://doi.org/10.18093/0869-0189-2013-0-4-77-81

Просмотров: 303

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


ISSN 0869-0189 (Print)
ISSN 2541-9617 (Online)