Определение лекарственной устойчивости и генотипирование клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis при помощи экспериментального набора "ТБ-ТЕСТ"
https://doi.org/10.18093/0869-0189-2013-0-4-77-81
Аннотация
Резюме. Проведен анализ лекарственной устойчивости 266 образцов геномной ДНК Mycobacterium tuberculosis с использованием экспериментального набора "ТБ-ТЕСТ". Этот метод основан на применении технологии олигонуклеотидных биочипов и позволяет определять наиболее распространенные в России генотипы патогена, а также мутации, ответственные за формирование резистентности к основным препаратам, применяемым для лечения туберкулеза, – рифампицину, изониазиду, этамбутолу, фторхинолонам, аминогликозидам и капреомицину. В результате были получены профили резистентности и определены генотипы для всех образцов. Тестируемый метод показал хорошую корреляцию результатов с данными классических микробиологических тестов. Разработанная система "ТБ-ТЕСТ" является приоритетной для использования в клинической лабораторной диагностике.
Ключевые слова
Об авторах
Ю. А. БеспятыхРоссия
м. н. с. лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов
119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а. Тел.: 8 (909) 961-18-46.
Е. А. Шитиков
Россия
науч. сотр. лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов
119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а. Тел.: 8 (916) 835-24-32.
Д. В. Зименков
Россия
к. б. н., науч. сотр. лаборатории биологических микрочипов
119991, Москва, ул. Вавилова, 32. Тел.: (499) 135-98-46.
Е. В. Кулагина
Россия
науч. сотр. лаборатории биологических микрочипов
119991, Москва, ул. Вавилова, 32. Тел.: (499) 135-98-46.
Д. А. Грядунов
Россия
к. б. н., ведущий научный сотрудник лаборатории биологических микрочипов
119991, Москва, ул. Вавилова, 32. Тел.: (499) 135-98-46.
Е. Ю. Носова
Россия
к. м. н., науч. сотр.
107014, Москва, ул. Стромынка, 10. Тел.: (499) 268-01-31.
А. А. Букатина
Россия
науч. сотр.
107014, Москва, ул. Стромынка, 10. Тел.: (499) 268-01-31.
М. В. Шульгина
Россия
д. б. н., руководитель лаборатории этиологической диагностики
191036, Санкт-Петербург, Лиговский пр., 2–4. Тел.: (812) 579-24-21.
В. Ю. Журавлев
Россия
к. м. н., в. н. с. лаборатории этиологической диагностики
191036, Санкт-Петербург, Лиговский пр., 2–4. Тел.: (812) 579-24-21.
Е. Н. Ильина
Россия
д. б. н., зав. лабораторией молекулярной генетики микроорганизмов
119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а. Тел.: (499) 245-04-70.
Список литературы
1. Бюллетень ВОЗ. Европейское региональное бюро ВОЗ; 2012: 90. http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/83803/1/9789244505113-rus.pdf
2. CDC. Notice to readers: Revised Definition of extensively drug-resistant tuberc. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2006; 55 (43): 1176.
3. Zignol M., Hosseini M. S., Wright A. et al. Global incidence of multidrug-resistant tuberculosis. Infect. Dis. 2006; 194: 479–485.
4. Нарвская О.В., Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф. и др. Генетическое маркирование полирезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на Северо-Западе России. Пробл. туб. 1999; 3: 39–41.
5. Нарвская О.В. Геномный полиморфизм Mycobacterium tuberculosis и его роль в эпидемическом процессе: Автореф. дис. … д-ра мед. наук. СПб.; 2003.
6. Toungoussova O., Sandven P., Mariandyshev A. et al. Spread of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing genotype in the Archangel Oblast, Russia. J. Clin. Microbiol 2002; 40: 1930–1937.
7. Вишневский Б.И., Нарвская О.В., Васильева С.Н. и др. Вирулентность микобактерий туберкулеза. Пробл. туб. 2002; 10: 33–36.
8. Черноусова Л.Н., Андреевская С.Н., Смирнова Т.Г. и др. Биологические свойства штаммов M. tuberculosis кластера W. Пробл. туб. и бол. легких 2008; 10: 45–50.
9. Lopez B., Aguilar D., Orozco H. et al. A marked difference in pathogenesis and immune response induced by different Mycobacterium tuberculosis genotypes. Clin. Exp. Immunol. 2003; 133: 37.
10. Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A. et al. Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype in Russia: in Search of Informative Variable-Number Tandem-Repeat Loci. J Clin Microbiol 2008; 46: 3576–3584.
11. Kruuner A., Hoffner S. E., Sillastu H. et al. Spread of drugresistant pulmonary tuberculosis in Estonia. J. Clin. Microbiol. 2001; 39: 3339–3345.
12. Gryadunov D., Dementieva E., Mikhailovich V. et al. Gelbased microarrays in clinical diagnostics in Russia. Exp. Rev. Mol. Diagn. 2011; 11 (8): 839–853
13. Gryadunov D., Mikhailovich V., Lapa S. et al. Evaluation of hybridisation on oligonucleotide microarrays for analysis of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. Clin. Microbiol. Infect. 2005; 11: 531–539.
14. Zimenkov D.V., Antonova O.V., Kuz'min A.V. et al. Detection of second-line drug resistance in Mycobacterium tuberculosis using oligonucleotide microarrays. BMC Infect. Dis. 2013; 13: 240.
15. Mokrousov I., Otten T., Vyshnevskiy B. et al. Detection of embB306 mutations in ethambutol-susceptible clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from northwestern Russia: implications for genotypic resistance testing. J. Clin. Microbiol. 2002; 40: 3810–3813.
16. Hazbon M.H., Bobadilla del Valle M., Guerrero M.I. et al. Role of embB codon 306 mutations in Mycobacterium tuberculosis revisited: a novel association with broad drug resistance and IS6110 clustering rather than ethambutol resistance. Antimicrob. Agents Chemother. 2005; 49: 3794–3802.
Рецензия
Для цитирования:
Беспятых Ю.А., Шитиков Е.А., Зименков Д.В., Кулагина Е.В., Грядунов Д.А., Носова Е.Ю., Букатина А.А., Шульгина М.В., Журавлев В.Ю., Ильина Е.Н. Определение лекарственной устойчивости и генотипирование клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis при помощи экспериментального набора "ТБ-ТЕСТ". Пульмонология. 2013;(4):77-81. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2013-0-4-77-81
For citation:
Bespyatykh Yu.A., Shitikov E.A., Zimenkov D.V., Kulagina E.V., Gryadunov D.A., Nosova E.Yu., Bukatina А.А., Shulgina M.V., Zhuravlev V.Yu., Ilyina E.N. Identification of drug resistance and genotyping of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis using the TB-TEST. PULMONOLOGIYA. 2013;(4):77-81. (In Russ.) https://doi.org/10.18093/0869-0189-2013-0-4-77-81