Preview

Пульмонология

Расширенный поиск

Молекулярно-эпидемиологический анализ рифампицин устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на территории Кыргызской Республики

https://doi.org/10.18093/0869-0189-2006-2-48-52

Полный текст:

Аннотация

Для разных стран характерна разная частота встречаемости отдельных мутаций гена rpoB Mycobacterium tuberculosis (MBT). Учитывая регионально-географические особенности распространения мутаций в гене rpoB, обуславливающих резистентность к рифампицину, мы
изучили спектр мутаций гена rpoB микобактерий туберкулеза (МБТ), циркулирующих на территории Кыргызской республики (КР).
Исследовано 605 образцов ДНК МБТ, выделенных от больных туберкулезом, проживающих в восьми регионах КР. Устойчивость МБТ
к рифампицину идентифицировали методом биологических микрочипов. Методом биологических микрочипов выявлено 380 (62,8 %)
чувствительных и 225 (37,2 %) рифампицин устойчивых штаммов МБТ. Среди проанализированных рифампицин устойчивых штаммов
МБТ нам удалось выявить 18 различных типов мутаций, локализованных в 8 кодонах гена rpoB. При этом мутации в 531-м и 526-м кодонах встречались наиболее часто и обуславливали устойчивость к рифампицину в 80 % случаев. Среди всех рифампицин устойчивых
штаммов у 137 из 225 (60,8 %) образцов обнаружена мутация в 531-м кодоне, при этом Ser531®Leu идентифицирована в 59,4 % (134 из
225) случаев. Вторым по частоте встречаемости является мутация в 526-м кодоне 19,1 % (43 из 225). В 526-м кодоне выявлено 5 различных типов мутаций: в том числе His526®Tyr - 4,9 %; His526®Asp - 4,9 %; His526®Arg - 4 %; His526®Leu - 3,5 %; His526®Pro - 1,8 %.
Третьими по частоте встречаемости являются мутации в 516-м и 511-м кодонах. В 516-м кодоне выявлено Asp516®Tyr - 4,4 % и
Asp516®Val - 0,8 % случаев. В 511-м кодоне основной мутацией является Leu511®Pro - 6,3 %. Мутации в 533, 522, 513, 512-м кодонах
встречались редко. Частота встречаемости каждой из мутаций в 533, 522, 513-м кодонах среди всех рифампицин устойчивых штаммов
составила всего 1,8 %, а мутация в 512-м кодоне встречалась в 1,4 % случаев.

Список литературы

1. Gillespie S.H. Evolution of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis: Clinical and molecular perspective. Antimicrob. Agents Chemother. 2002; 46 (2): 267-274.

2. Ramaswamy S., Musser J.M. Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis. Tubercle Lung Dis. 1998; 79 (1): 3-29.

3. Bodmer T., Zurcher G., Imboden P. et al. Mutation position and type of substitution in the B subunit of the RNA polymerase influence in vitro activity of rifamycins in rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis. J. Antimicrob. Chemother. 1995; 35: 345-348.

4. Михайлович В.М., Лапа С.А., Грядунов Д.А. и др. Использование методов гибридизации и ПЦР на специализированном ТБ-микрочипе для обнаружения рифампицин резистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis. Бюл. экспер. биол. 2001; 1: 112-117.

5. Drobnienski F.A., Wilson S.M. The rapid diagnosis of isoniazid and rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis - a molecular story. J. Med. Microbiol. 1998;47: 189-196.

6. Скотникова О.И., Михайлович В.М., Носова Е.Ю. и др. Новые технологии определения лекарственной чувствительности Mycobacterium Tuberculosis. Пробл. туб. 2004; 6: 40-43.

7. Генерозов Э.В., Альтшулер М.Л., Говорун В.М. и др. Детекция и характеристика мутаций в гене rpoВ резистентных к рифампицину клинических штаммов M. tuberculosis. Бюл. экспер. биол. 1999; 2: 39-42.

8. Tracevska T., Jansone I., Broka L. et al. Mutations in the rpoB and katG genes leading to drug resistance in Mycobacterium tuberculosis in Latvia. J.Clin. Microbiol. 2002; 40 (12): 3789-3792.

9. Valim A.M., Rossettu M.R., Ribeiro M.O. et al. Mutations in the rpoB gene of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from Brazil. J. Clin. Microbiol. 2000; 38 (8): 3119-3122.

10. Qian L., Abe C., Lin T. et al. rpoB genotypes of Mycobacterium tuberculosis beijing family isolates from East Asian countries. J. Clin. Microbiol. 2002; 40 (3): 1091-1094.

11. Kapur V., Li L.L., Iordanescu S. et al. Characterization by automated DNA sequencing of mutation in the gene (rpoB) encoding the RNA polymerase B subunit in rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from New York City and Texas. J. Clin. Microbiol. 1994; 32: 1095-1098.

12. Bartfai Z., Soomoskovi A., Kodmon C. et al. Molecular characterization of rifampin-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis from Hungary by DNA sequencing and the line probe Assay. J.Clin. Microbiol. 2001; 39 (10): 3736-3739.

13. Matsiota/Bernard P., Vrioni G., Marinis E. Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant clinical Mycobac terium tuberculosis isolates from Greece. J. Clin. Microbiol. 1998; 36 (1): 20-23.

14. Иманалиев М.Д., Гончарова З.К. Туберкулез в пенитенциарных учреждения Кыргызской Республики. В кн.: Туберкулез: Научные труды и материалы Международной конф. "Контроль над туберкулезом в странах Центрально-Азиатского региона", Чолпон-Ата, 22-25 мая 2003 г. Бишкек; 2003. 38-42.

15. Taniguchu H., Aramaki H., Nikaido Y. et al. Rifampicin resistance and mutation of the rpoB gene in Mycobacterium tuberculosis. FEMS Microbiol. Lett. 1996; 144: 103-108.


Для цитирования:


Исакова Ж., Пак О., Юсупова Э., Гончарова З., Тумашова А., Кожомкулов М., Кожомкулов Д., Чубаков Т., Алишеров А., Friedland J., Алдашев А. Молекулярно-эпидемиологический анализ рифампицин устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на территории Кыргызской Республики . Пульмонология. 2006;(2):48-52. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2006-2-48-52

Просмотров: 2


ISSN 0869-0189 (Print)
ISSN 2541-9617 (Online)