Смешанные бактериально-вирусные инфекции легких у пациентов с муковисцидозом
https://doi.org/10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496
Аннотация
Основной причиной смерти больных муковисцидозом (МВ) являются инфекционные процессы в легких, в частности, хронические инфекции легких (ХИЛ), вызываемые различными возбудителями, среди которых выявлены доминирующие, чаще всего в виде смешанного инфицирования, – бактериями, грибами, вирусами. Данные о смешанных бактериальных и бактериально-вирусных инфекциях (БВИ), полученных из отечественных и зарубежных источников, фрагментарны и немногочисленны. В настоящее время доминирующие ассоциации возбудителей бактериальной и вирусной природы у пациентов с МВ изучены недостаточно, отсутствуют данные об их эпидемиологической значимости. Целью работы являлась оценка распространенности БВИ и обоснование необходимости разработки системы вирусологического мониторинга у пациентов с МВ. Материалы и методы. Материалом для исследования послужили биоматериалы, полученные из дыхательных путей детей (n = 409) и взрослых (n = 160) больных МВ, обследованных в 2006–2022 гг. Исследование проводилось с помощью бактериологических, молекулярно-генетических методов (полимеразная цепная реакция (ПЦР) в режиме реального времени (РВ) с обратной транскрипцией; времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-ассоциированной лазерной десорбцией / ионизацией (Matrix-Assisted Laser Desorption / Ionization (MALDI) Time-Of-Flight (TOF)). Результаты. Показано, что микрофлора дыхательных путей у пациентов с МВ в 2/3 случаев является смешанной. Микрофлора легких у детей с МВ представляет собой динамичное сообщество микроорганизмов, характеризуемых большим разнообразием и изменчивостью. У взрослых больных ассоциации микроорганизмов встречаются чаще, чем у детей, но менее разнообразен состав ассоциаций. От выборки взрослых больных выделены около 40 видов бактерий (от детей – > 85 видов), среди который преобладали неферментирующие грамотрицательные микроорганизмы: Burkholderia cepacia complex, Pseudomonas aeruginosa, Achromobacter xylosoxidans, Achromobacter ruhlandii, Stenotrophomonas maltophilia, а также Staphylococcus aureus, Candida albicans и Aspergillus spp. По результатам ПЦР РВ показано наличие РНК риновируса в 10 % образцов, полученных от детей, и 12,9 % – от взрослых пациентов с МВ. Заключение. По результатам исследования обоснована необходимость постоянного мониторинга микрофлоры легких у больных МВ, включая исследование на вирусы.
Об авторах
Е. М. БурмистровРоссия
Бурмистров Егор Михайлович - научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
К. Г. Краснослободцев
Россия
Краснослободцев Кирилл Геннадьевич - научный сотрудник лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
Л. Р. Аветисян
Россия
Аветисян Лусине Ремуальдовна – доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
Е. А. Сиянова
Россия
Сиянова Екатерина Алексеевна — младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
О. С. Медведева
Россия
Медведева Ольга Сергеевна — младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
Е. Г. Целикина
Россия
Целикина Евгения Геннадьевна — младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
Н. Б. Поляков
Россия
Поляков Никита Борисович — научный сотрудник лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 190-74-22
Конфликт интересов:
Нет
А. И. Соловьев
Россия
Соловьев Андрей Иванович — доктор биологических наук, научный сотрудник лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 190-74-22
Конфликт интересов:
Нет
А. Ю. Воронкова
Россия
Воронкова Анна Юрьевна — кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник научно-клинического отдела муковисцидоза ФГБНУ «МГНЦ им. ак. Н.П. Бочкова» Министерства науки и высшего образования РФ; врач-педиатр отделения муковисцидоза ГБУЗ МО «НИКИ детства МЗ Московской области».
115522, Москва, ул. Москворечье, 1; 115093, Москва, ул. Большая Серпуховская, 62
тел.: (495) 111-03-03
Конфликт интересов:
Нет
Е. И. Кондратьева
Россия
Кондратьева Елена Ивановна — доктор медицинских наук, профессор, руководитель научно-клинического отдела муковисцидоза ФГБНУ «МГНЦ им. ак. Н.П. Бочкова» Министерства науки и высшего образования РФ; заместитель директора по науке ГБУЗ МО «НИКИ детства МЗ МО».
115522, Москва, ул. Москворечье, 1; 115093, Москва, ул. Большая Серпуховская, 62
тел.: (495) 111-03-03
Конфликт интересов:
Нет
С. А. Красовский
Россия
Красовский Станислав Александрович — кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории муковисцидоза.
115682, Москва, Ореховый бульвар, 28
тел: (495) 965-23-24
Author ID: 688178
Конфликт интересов:
Нет
В. Г. Жуховицкий
Россия
Жуховицкий Владимир Григорьевич — кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов ФГБУ «НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» МЗ РФ; доцент кафедры биохимии и иммунопатологии ФГБОУ ДПО «РМАНПО» МЗ РФ.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; 125993, Москва, ул. Баррикадная, 2 / 1, стр. 1
тел.: (499) 193-43-76
Конфликт интересов:
Нет
Е. И. Бурцева
Россия
Бурцева Елена Ивановна — доктор медицинских наук руководитель, ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
Н. А. Никитенко
Россия
Никитенко Наталья Анатольевна — кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории клеточной микробиологии, заведующая медицинским отделом.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-55-94
Конфликт интересов:
Нет
М. Ю. Чернуха
Россия
Чернуха Марина Юрьевна — доктор медицинских наук, заведующая лабораторией эпидемиологии госпитальных инфекций.
123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
тел.: (499) 193-61-17
Конфликт интересов:
Нет
Список литературы
1. Mashburn L.M., Jett A.M., Akins D.R., Whiteley M. Staphylococcus aureus serves as an iron source for Pseudomonas aeruginosa during in vivo coculture. J. Bacteriol. 2005; 187 (2): 554–566. DOI: 10.1128/JB.187.2.554-566.2005.
2. Mitchell G., Séguin D.L., Asselin A.E. et al. Staphylococcus aureus sigma B-dependent emergence of small-colony variants and biofilm production following exposure to Pseudomonas aeruginosa 4-hydroxy-2-heptylquinoline-N-oxide. BMC Microbiol. 2010; 10: 33. DOI: 10.1186/1471-2180-10-33.
3. Doing G., Koeppen K., Occipinti P. et al. Conditional antagonism in co-cultures of Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans: An intersection of ethanol and phosphate signaling distilled from dual-seq transcriptomics. PLoS Genet. 2020; 16 (8): e1008783. DOI: 10.1371/journal.pgen.1008783.
4. Аветисян Л.Р., Чернуха М.Ю., Шагинян И.А. и др. Применение современных методов в микробиологической диагностике хронической инфекции легких у больных муковисцидозом. Сибирское медицинское обозрение. 2019; (2): 70–79. Доступно на: https://smr.krasgmu.ru/journal/1901_8_avetisyan.pdf
5. Домонова Э.А., Творогова М.Г., Подколзин А.Т. и др. Взятие, транспортировка, хранение биологического материала для ПЦР-диагностики: методические рекомендации. М.; 2021. Доступно на: https://prepcr.crie.ru/docs/Metodicheskie_Rekomendacii.pdf
6. Чернуха М.Ю., Аветисян Л.Р., Шагинян И.А. и др. Алгоритм микробиологической диагностики хронической инфекции легких у больных муковисцидозом. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014; 16 (4): 312–316. Доступно на: https://cyberleninka.ru/article/n/algoritm-mikrobiologicheskoy-diagnostiki-hronicheskoy-infektsii-lyogkih-u-bolnyh-mukovistsidozom?ysclid=lionrjfsdc41788035
7. Hotterbeekx A., Kumar-Singh S., Goossens H., Malhotra-Kumar S. In vivo and In vitro Interactions between Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus spp. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2017; 7: 106. DOI: 10.3389/fcimb.2017.00106.
8. Чернуха М.Ю., Шагинян И.А., Капранов Н.И. и др. Персистенция Burkholderia cepacia у больных муковисцидозом. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2012; (4): 93–98. Доступно на: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13755
9. Salsgiver E.L., Fink A.K., Knapp E.A. et al. Changing epidemiology of the respiratory Bacteriology of patients with cystic fibrosis. Chest. 2016; 149 (2): 390–400. DOI: 10.1378/chest.15-0676.
10. Kiedrowski M.R., Gaston J.R., Kocak B.R. et al. Staphylococcus aureus biofilm growth on cystic fibrosis airway epithelial cells is enhanced during respiratory syncytial virus coinfection. mSphere. 2018; 3 (4): e00341-18. DOI: 10.1128/mSphere.00341-18.
Дополнительные файлы
Рецензия
Для цитирования:
Бурмистров Е.М., Краснослободцев К.Г., Аветисян Л.Р., Сиянова Е.А., Медведева О.С., Целикина Е.Г., Поляков Н.Б., Соловьев А.И., Воронкова А.Ю., Кондратьева Е.И., Красовский С.А., Жуховицкий В.Г., Бурцева Е.И., Никитенко Н.А., Чернуха М.Ю. Смешанные бактериально-вирусные инфекции легких у пациентов с муковисцидозом. Пульмонология. 2023;33(4):488-496. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496
For citation:
Burmistrov E.M., Krasnoslobodtsev K.G., Avetisyan L.R., Siyanova E.A., Medvedeva O.S., Tselikina E.G., Polyakov N.B., Solovyev A.I., Voronkova A.Yu., Kondratyeva E.I., Krasovskiy S.A., Zhukhovitsky V.G., Burtseva E.I., Nikitenko N.A., Chernukha M.Yu. Mixed bacterial-viral lung infections in patients with cystic fibrosis. PULMONOLOGIYA. 2023;33(4):488-496. (In Russ.) https://doi.org/10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496