Молекулярно-эпидемиологический анализ рифампицин-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на территории Кыргызской Республики

Для разных стран характерна разная частота встречаемости отдельных мутаций гена rpoB Mycobacterium tuberculosis. Учитывая регионально-географические особенности распространения мутаций в гене rpoB, обуславливающих резистентность к рифампицину, мы изучили спектр мутаций гена rpoB МБТ, циркулирующих на территории Кыргызской Республики. Исследовано 605 образцов ДНК МБТ, выделенных от больных туберкулезом, проживающих в 8 регионах Кыргызской Республики. Устойчивость МБТ к рифампицину идентифицировали методом биологических микрочипов. Методом биологических микрочипов выявлено 380 (62,8 %) чувствительных и 225 (37,2 %) рифампицин-устойчивых штаммов МБТ. Среди проанализированных рифампицин-устойчивых штаммов МБТ нам удалось выявить 18 различных типов мутаций, локализованных в 8 кодонах гена rpoB. При этом мутации в 531 и 526 кодонах встречались наиболее часто и обуславливали устойчивость к рифампицину в 80,0 % случаев. Среди всех рифампицин-устойчивых штаммов у 137 из 225 (60,8 %) образцов обнаружена мутация в 531 кодоне, при этом Ser531®Leu идентифицирована в 59,4 % (134 из 225) случаев. Второй по частоте встречаемости является мутация в 526 кодоне 19,1 % (43 из 225). В 526 кодоне выявлено 5 различных типов мутаций, в том числе His526®Tyr – 4,9 %; His526®Asp – 4,9 %; His526®Arg – 4,0 %; His526®Leu – 3,5 %; His526®Pro – 1,8 %. Третьими по частоте встречаемости являются мутации в 516 и 511 кодонах. В 516 кодоне выявлено Asp516®Tyr – 4,4 % и Asp516®Val – 0,8 % случаев. В 511 кодоне основной мутацией является Leu511®Pro – 6,3%. Мутации в 533, 522, 513 и 512 кодонах встречались редко. Частота встречаемости каждой из мутаций в 533, 522 и 513 кодонах среди всех рифампицин-устойчивых штаммов составила всего 1,8 %, а мутация в 512 кодоне встречалась в 1,4 % случаев.

1. Gillespie S.H. Evolution of drug resistance in mycobacterium tuberculosis: clinical and molecular perspective. Antimicrob. Agents Chemother. 2002; 46 (2): 267–274.

2. Ramaswamy S., Musser J.M. Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis. Tubercle Lung Dis. 1998; 79 (1): 3–29.

3. Taniguchu H., Aramaki H., Nikaido Y. et al. Rifampicin resistance and mutation of the rpoB gene in Mycobacterium tuberculosis. FEMS Microbiol. Lett. 1996; 144: 103–108.

4. Bodmer T., Zurcher G., Imboden P., et al. Mutation position and type of substitution in the B subunit of the RNA polymerase influence in-vitro activity of rifamycins in rifampicin-resistant Mycobacterium Tuberculosis. J. Antimicrob. Chemother. 1995; 35: 345–348.

5. Михайлович В.М., Лапа С.А., Грядунов Д.А., и др. Использование методов гибридизации и ПЦР на специализированном ТБ-микрочипе для обнаружения рифампицин резистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis. Бюл. экспер. биол. мед. 2001; 1: 112–117.

6. Drobnienski F. A., Wilson S.M. The rapid diagnosis of isoniazid and rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis – a molecular story. J. Med. Microbiol. 1998; 47: 189–196.

7. Скотникова О.И., Михайлович В.М., Носова Е.Ю. и др. Новые технологии определения лекарственной чувствительности Mycobacterium tuberculosis. Пробл. туб. 2004; 6: 40–43.

8. Генерозов Э.В., Альтшулер М.Л., Говорун В.М. и др. Детекция и характеристика мутаций в гене rpoВ резистентных к рифампицину клинических штаммов M. tuberculosis. Бюл. экспер. Биол. 1999; 2: 39–42.

9. Tracevska T., Jansone I., Broka L. et al. Mutations in the rpoB and katG genes leading to drug resistance in Mycobacterium tuberculosis in Latvia. J.Clin. Microbiol. 2002; 40 (10): 3789–3792.

10. Valim A.M., Rossettu M.R., Ribeiro M.O. et al. Mutations in the rpoB Gene of Multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates from Brazil. J.Clin. Microbiol. 2000; 38 (8): 3119–3122.

11. Qian L., Abe C., Lin T., et al. rpoB genotypes of Mycobacterium tuberculosis Beijing family isolates from East Asian Countries. J. Clin. Microbiol. 2002; 40 (3): 1091–1094.

12. Kapur V., Li L.L., Iordanescu S., et al. Characterization by automated DNA sequencing of mutation in the gene (rpoB) encoding the RNA polymerase B subunit in rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from New York City and Texas. J. Clin. Microbiol. 1994; 32: 1095–1098.

13. Bartfai Z., Soomoskovi A., Kodmon C., et al. Molecular characterization of rifampin-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis from Hungary by DNA sequencing and the line probe assay. J. Clin. Microbiol. 2001; 39 (10): 3736–3739.

14. Matsiota-Bernard P., Vrioni G., Marinis E. Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant clinical Mycobacterium tuberculosis isolates from Greece. J. Clin. Microbiol. 1998; 36 (1): 20–23.

15. Иманалиев М.Д., Гончарова З.К. Туберкулез в пенитенциарных учреждения Кыргызской Республики. В кн.: Туберкулез: Научные труды и материалы Международной конференции "Контроль над туберкулезом в странах Центрально-Азиатского региона", Чолпон-Ата, 22–25 мая 2003 г. Бишкек; 2003. 38–42.