Preview

Пульмонология

Расширенный поиск

Молекулярно-эпидемиологический анализ рифампицин-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на территории Кыргызской Республики

https://doi.org/10.18093/0869-0189-2007-0-2-44-48

Полный текст:

Аннотация

Для разных стран характерна разная частота встречаемости отдельных мутаций гена rpoB Mycobacterium tuberculosis. Учитывая регионально-географические особенности распространения мутаций в гене rpoB, обуславливающих резистентность к рифампицину, мы изучили спектр мутаций гена rpoB МБТ, циркулирующих на территории Кыргызской Республики. Исследовано 605 образцов ДНК МБТ, выделенных от больных туберкулезом, проживающих в 8 регионах Кыргызской Республики. Устойчивость МБТ к рифампицину идентифицировали методом биологических микрочипов. Методом биологических микрочипов выявлено 380 (62,8 %) чувствительных и 225 (37,2 %) рифампицин-устойчивых штаммов МБТ. Среди проанализированных рифампицин-устойчивых штаммов МБТ нам удалось выявить 18 различных типов мутаций, локализованных в 8 кодонах гена rpoB. При этом мутации в 531 и 526 кодонах встречались наиболее часто и обуславливали устойчивость к рифампицину в 80,0 % случаев. Среди всех рифампицин-устойчивых штаммов у 137 из 225 (60,8 %) образцов обнаружена мутация в 531 кодоне, при этом Ser531®Leu идентифицирована в 59,4 % (134 из 225) случаев. Второй по частоте встречаемости является мутация в 526 кодоне 19,1 % (43 из 225). В 526 кодоне выявлено 5 различных типов мутаций, в том числе His526®Tyr – 4,9 %; His526®Asp – 4,9 %; His526®Arg – 4,0 %; His526®Leu – 3,5 %; His526®Pro – 1,8 %. Третьими по частоте встречаемости являются мутации в 516 и 511 кодонах. В 516 кодоне выявлено Asp516®Tyr – 4,4 % и Asp516®Val – 0,8 % случаев. В 511 кодоне основной мутацией является Leu511®Pro – 6,3%. Мутации в 533, 522, 513 и 512 кодонах встречались редко. Частота встречаемости каждой из мутаций в 533, 522 и 513 кодонах среди всех рифампицин-устойчивых штаммов составила всего 1,8 %, а мутация в 512 кодоне встречалась в 1,4 % случаев.

Об авторах

Ж. Т. Исакова
Институт молекулярной биологии и медицины при Национальном центре кардиологии и терапии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


О. А. Пак
Институт молекулярной биологии и медицины при Национальном центре кардиологии и терапии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


Э. У. Юсупова
Институт молекулярной биологии и медицины при Национальном центре кардиологии и терапии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


З. А. Гончарова
Национальный центр фтизиатрии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


А. Ф. Тумашова
Национальный центр фтизиатрии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


М. Д. Кожомкулов
Национальный центр фтизиатрии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


Д. К. Кожомкулов
Национальный центр фтизиатрии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


Т. Ч. Чубаков
Национальный центр фтизиатрии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


А. Ш. Алишеров
Национальный центр фтизиатрии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


Дж. Фридленд
Hammersmith Hospita
Великобритания
г. Лондон


А. А. Алдашев
Институт молекулярной биологии и медицины при Национальном центре кардиологии и терапии при МЗ КР
Кыргызстан
г. Бишкек


Список литературы

1. Gillespie S.H. Evolution of drug resistance in mycobacterium tuberculosis: clinical and molecular perspective. Antimicrob. Agents Chemother. 2002; 46 (2): 267–274.

2. Ramaswamy S., Musser J.M. Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis. Tubercle Lung Dis. 1998; 79 (1): 3–29.

3. Taniguchu H., Aramaki H., Nikaido Y. et al. Rifampicin resistance and mutation of the rpoB gene in Mycobacterium tuberculosis. FEMS Microbiol. Lett. 1996; 144: 103–108.

4. Bodmer T., Zurcher G., Imboden P., et al. Mutation position and type of substitution in the B subunit of the RNA polymerase influence in-vitro activity of rifamycins in rifampicin-resistant Mycobacterium Tuberculosis. J. Antimicrob. Chemother. 1995; 35: 345–348.

5. Михайлович В.М., Лапа С.А., Грядунов Д.А., и др. Использование методов гибридизации и ПЦР на специализированном ТБ-микрочипе для обнаружения рифампицин резистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis. Бюл. экспер. биол. мед. 2001; 1: 112–117.

6. Drobnienski F. A., Wilson S.M. The rapid diagnosis of isoniazid and rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis – a molecular story. J. Med. Microbiol. 1998; 47: 189–196.

7. Скотникова О.И., Михайлович В.М., Носова Е.Ю. и др. Новые технологии определения лекарственной чувствительности Mycobacterium tuberculosis. Пробл. туб. 2004; 6: 40–43.

8. Генерозов Э.В., Альтшулер М.Л., Говорун В.М. и др. Детекция и характеристика мутаций в гене rpoВ резистентных к рифампицину клинических штаммов M. tuberculosis. Бюл. экспер. Биол. 1999; 2: 39–42.

9. Tracevska T., Jansone I., Broka L. et al. Mutations in the rpoB and katG genes leading to drug resistance in Mycobacterium tuberculosis in Latvia. J.Clin. Microbiol. 2002; 40 (10): 3789–3792.

10. Valim A.M., Rossettu M.R., Ribeiro M.O. et al. Mutations in the rpoB Gene of Multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates from Brazil. J.Clin. Microbiol. 2000; 38 (8): 3119–3122.

11. Qian L., Abe C., Lin T., et al. rpoB genotypes of Mycobacterium tuberculosis Beijing family isolates from East Asian Countries. J. Clin. Microbiol. 2002; 40 (3): 1091–1094.

12. Kapur V., Li L.L., Iordanescu S., et al. Characterization by automated DNA sequencing of mutation in the gene (rpoB) encoding the RNA polymerase B subunit in rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from New York City and Texas. J. Clin. Microbiol. 1994; 32: 1095–1098.

13. Bartfai Z., Soomoskovi A., Kodmon C., et al. Molecular characterization of rifampin-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis from Hungary by DNA sequencing and the line probe assay. J. Clin. Microbiol. 2001; 39 (10): 3736–3739.

14. Matsiota-Bernard P., Vrioni G., Marinis E. Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant clinical Mycobacterium tuberculosis isolates from Greece. J. Clin. Microbiol. 1998; 36 (1): 20–23.

15. Иманалиев М.Д., Гончарова З.К. Туберкулез в пенитенциарных учреждения Кыргызской Республики. В кн.: Туберкулез: Научные труды и материалы Международной конференции "Контроль над туберкулезом в странах Центрально-Азиатского региона", Чолпон-Ата, 22–25 мая 2003 г. Бишкек; 2003. 38–42.


Для цитирования:


Исакова Ж.Т., Пак О.А., Юсупова Э.У., Гончарова З.А., Тумашова А.Ф., Кожомкулов М.Д., Кожомкулов Д.К., Чубаков Т.Ч., Алишеров А.Ш., Фридленд Д., Алдашев А.А. Молекулярно-эпидемиологический анализ рифампицин-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на территории Кыргызской Республики. Пульмонология. 2007;(2):44-48. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2007-0-2-44-48

For citation:


Isakova G.T., Pak O.A., Yusupova A.U., Goncharova Z.A., Tumashova A.F., Kozhomkulov M.D., Kozhomkulov D.K., Сhubakov T.C., Alisherov A.S., Friedland J., Aldashev A.A. Molecular and epidemiological characterization of rpoB mutations in rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis in Kyrgyz Republic. PULMONOLOGIYA. 2007;(2):44-48. (In Russ.) https://doi.org/10.18093/0869-0189-2007-0-2-44-48

Просмотров: 23


ISSN 0869-0189 (Print)
ISSN 2541-9617 (Online)