pulmoПульмонологияPULMONOLOGIYA0869-01892541-9617Scientific and Practical Journal “PULMONOLOGIYA” LLC10.18093/0869-0189-2024-4446pulmo-4446Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL STUDIESМикробный пейзаж дыхательных путей у пациентов с первичной цилиарной дискинезией: пилотное исследованиеAirway microbial landscape in patients with primary ciliary dyskinesia – a pilot studyhttps://orcid.org/0000-0002-2349-8556ЧернухаМ. Ю.ChernukhaM. Yu.

Чернуха Марина Юрьевна – д. м. н., заведующая лабораторией эпидемиологии госпитальных инфекций.

123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; тел.: (499)193-61-17

Marina Yu. Chernukha, Doctor of Medicine, Head of the Laboratory of Epidemiology of Nosocomial Infections

Ul. Gamaleya 18, Moscow, 123098; tel.: (499) 193-61-17

chernukha@gamaleya.orghttps://orcid.org/0000-0001-6395-0407КондратьеваЕ. И.KondratyevaE. I.

Кондратьева Елена Ивановна – д. м. н., профессор, руководитель научно-клинического отдела муковисцидоза, заведующая кафедрой генетики болезней дыхательной системы Института высшего и дополнительного профессионального образования.

115522, Москва, ул. Москворечье, 1; тел.: (495) 111-03-03; Scopus ID: 36737150600

Elena I. Kondratyeva - Doctor of Medicine, Professor, Head of the Scientific and Clinical Department of cystic fibrosis, Head of the Department of Genetics of Respiratory System Diseases, Institute of Higher and Additional Professional Education.

ul. Moskvorechye 1, Moscow, 115522; Scopus ID: 36737150600; tel.: (495) 111-03-03

elenafpk@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0005-7835-8891ДомблидесЭ. А.DomblidesE. A.

Домблидес Эдвард Артурович – младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.

123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; тел.: (499) 193-55-94

Edward A. Domblides - Junior Researcher, Laboratory of Epidemiology of Nosocomial Infections.

ul. Gamaleya 18, Moscow, 123098; tel.: (499) 193-55-94

domblides@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-9053-2515АветисянЛ. Р.AvetisyanL. R.

Аветисян Лусине Ремуальдовна – д. м. н., заведующая лабораторией эпидемиологии оппортунистических инфекций.

123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; тел.: (499) 193-55-94

Lusine R. Avetisyan - Doctor of Medicine, head of the Laboratory of epidemiology of opportunistic infections.

ul. Gamaleya 18, Moscow, 123098; tel.: (499) 193-55-94

lusavr@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8183-7990ВоронковаА. Ю.VoronkovaA. Yu.

Воронкова Анна Юрьевна – к. м. н., ведущий научный сотрудник научно-клинического отдела муковисцидоза.

115522, Москва, ул. Москворечье, 1; тел.: (495) 111-03-03; Scopus ID: 57189352251

Anna Yu. Voronkova - Candidate of Medicine, Leading Researcher, Scientific and Clinical Department of Cystic Fibrosis.

ul. Moskvorechye 1, Moscow, 115522; tel.: (495) 111-03-03; Scopus ID: 57189352251

voronkova111@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8281-1162КиянТ. А.KyianT. A.

Киян Татьяна Анатольевна – к. м. н., старший научный сотрудник научно-клинического отдела муковисцидоза.

115522, Москва, ул. Москворечье, 1; тел.: (499) 324-15-01; Scopus ID: 57205414678

Tatiana A. Kyian - Candidate of Medicine, Senior Researcher, Scientific and Clinical Department of Cystic.

ul. Moskvorechye 1, Moscow, 115522; tel.: (499) 324-15-01; Scopus ID: 57205414678

bogdanovatata87@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-4653-2446ЖуховицкийВ. Г.ZhukhovitskyV. G.

Жуховицкий Владимир Григорьевич – к. м. н., заведующий лабораторией индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов; доцент кафедры клинической лабораторной диагностики с курсом лабораторной иммунологии.

123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; 125993, Москва, ул. Баррикадная, 2 / 1, стр. 1 тел.: (499) 193-43-76

Vladimir G. Zhukhovitsky - Candidate of Medicine, Head of the Laboratory of Indication and Ultrastructural Analysis of Microorganisms; Associate Professor, Department Сlinical Laboratory Diagnostics with a course in Laboratory Immunology.

Ul. Gamaleya 18, Moscow, 123098; ul. Barrikadnaya 2/1, Moscow, 123995; tel.: (499) 193-43-76

zhukhovitsky@rambler.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1647-5815ПоляковН. Б.PolyakovN. B.

Поляков Никита Борисович – научный сотрудник лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов.

123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; тел.: (499) 190-74-22

Nikita B. Polyakov - Researcher, Laboratory of Indication and Ultrastructural Analysis of Microorganisms.

Ul. Gamaleya 18, Moscow, 123098; tel.: (499) 190-74-22

polyakovnb@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-2518-6801БурцеваЕ. И.BurtsevaE. I.

Бурцева Елена Ивановна – д. м. н., ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа.

123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; тел.: (499) 193-55-94

Elena I. Burtseva - Doctor of Medicine, Head of Laboratory of Etiology and Epidemiology of Influenza.

Ul. Gamaleya 18, Moscow, 123098; tel.: (499) 193-55-94

elena-burtseva@yandex.ruФедеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияFederal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”Russian FederationФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова» Министерства науки и высшего образования Российской ФедерацииРоссияFederal State Budgetary Scientific Institution “Research Centre for Medical Genetics”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian FederationRussian FederationФедеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияFederal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”Russian FederationФедеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияFederal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F.Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”Russian FederationФедеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации; Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияFederal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”; Federal State Budgetary Educational Institution of Additional Professional Education “Russian Medical Academy of Continuous Professional Education”, Ministry of Health of RussiaRussian Federation202525062025353351358Copyright © Чернуха М.Ю., Кондратьева Е.И., Домблидес Э.А., Аветисян Л.Р., Воронкова А.Ю., Киян Т.А., Жуховицкий В.Г., Поляков Н.Б., Бурцева Е.И., 20252025Чернуха М.Ю., Кондратьева Е.И., Домблидес Э.А., Аветисян Л.Р., Воронкова А.Ю., Киян Т.А., Жуховицкий В.Г., Поляков Н.Б., Бурцева Е.И.Chernukha M.Y., Kondratyeva E.I., Domblides E.A., Avetisyan L.R., Voronkova A.Y., Kyian T.A., Zhukhovitsky V.G., Polyakov N.B., Burtseva E.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.pulmonology.ru/pulm/article/view/4446

Первичная цилиарная дискинезия (ПЦД) – редкое наследственное заболевание из группы цилиопатий, в основе которого лежит дефект ультраструктуры ресничек эпителия респираторного тракта и аналогичных им структур (жгутики сперматозоидов, ворсины фаллопиевых труб, эпендимы желудочков), с распространенностью от 1 : 10 000 до 1 : 30 000 населения. Одна из главных проблем при ПЦД – частые рецидивирующие бактериальные инфекции, которые приводят к снижению функции легких и развитию бронхоэктазов.

Целью исследования явилось изучение микробного пейзажа дыхательных путей пациентов с ПЦД.

Материалы и методы

Материалы и методы. В анализ вошли данные пациентов (n = 64) с диагнозом ПЦД. Было проведено бактериологическое исследование 170 образцов из зева, носа и мокроты. Для идентификации микроорганизмов применялись бактериологические методы, вирусологические исследования на возбудителей острой респираторной вирусной инфекции с применением полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией, а также масс-спектрометриия MALDI-TOF.

Результаты

Результаты. При исследовании выделены 46 видов бактерий, 4 вида вирусов и представители 2 родов грибов. Среди бактерий доминировали Staphylococcus aureus (62,5 %) и Pseudomonas aeruginosa (26,6 %). У пациентов во всех возрастных группах в единичных случаях выделялись Achromobacter spp., Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter spp. и Moraxella spp. У 7 пациентов обнаружены вирусы: Adenoviridae, Coronaviridae, Rhinoviridae – в ассоциации с представителями нормальной микрофлоры и клинически значимыми микроорганизмами, такими как S. aureus, Klebsiella pneumoniae, P. aeruginosa. Среди грибов отмечены Candida spp. и Aspergillus spp.

Заключение

Заключение. Микрофлора дыхательных путей пациентов с ПЦД характеризуется видовым разнообразием возбудителей. У 79,7 % пациентов микрофлора смешанная, у 10,9 % – наблюдаются вирусно-бактериальные ассоциации. В группе детей и подростков доминирующий возбудитель – S. aureus (58,3 % и 82,6 % соответственно), тогда как у взрослых пациентов преобладает P. aeruginosa (52,9 %).

Primary ciliary dyskinesia (PCD) is a rare hereditary disease belonging to the group of ciliopathies. PCD is caused by a defect in the ultrastructure of the cilia of the respiratory epithelium and similar structures (sperm flagella, fallopian tube villi, ventricular ependyma) with a prevalence of 1:10,000 to 1:30,000 people. One of the main problems associated with this condition is frequent recurrent bacterial infections, which lead to decreased lung function and the development of bronchiectasis.

The aim was to study the microbial landscape of the respiratory tract of patients with PCD.

Methods

Methods. We studied the medical history and bacteriological assays of 170 throat, nasal, and sputum samples from 64 patients diagnosed with PCD. virological studies on pathogens of acute respiratory viral infection, using polymerase chain reaction with reverse transcription, and MALDITOF mass spectrometry were used to identify microorganisms.

Results

Results. The assay identified 46 bacterial species, 4 viral species, and representatives of 2 fungal genera. The predominant bacteria were Staphylococcus aureus (62.5%) and Pseudomonas aeruginosa (26.6%). The identified fungi were Candida spp. and Aspergillus spp. Viruses (Adenoviridae, Coronaviridae, Rhinoviridae) were detected in 7 patients in association with representatives of normal microflora and clinically significant microorganisms such as S. aureus, Klebsiella pneumoniae, P. aeruginosa. Achromobacter spp., Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter spp., and Moraxella spp. were isolated in individual cases in patients of all age groups.

Conclusion

Conclusion. The respiratory microflora was characterized by a species diversity of pathogens and was mixed in 79.7% of patients. A viral-bacterial associations was observed in 10.9% of patients. S. aureus was the predominant pathogen in the group of children and adolescents (58.3% and 82.6%, respectively), whereas P. aeruginosa predominated (52.9%) in the adult patients.

первичная цилиарная дискинезияинфекции дыхательных путейассоциации возбудителейprimary ciliary dyskinesiarespiratory tract infectionspathogen associationsФинансовая поддержка исследования отсутствовала. Авторы выражают благодарность за помощь в работе при выполнении бактериологических исследований д. м. н., профессору, академику РАН С.Н.Авдееву, а также сотрудникам Федерального государственного бюджетного учреждения «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф.Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации А.И.Соловьеву, К.Г.Краснослободцеву, Е.М.Бурмистрову, Н.А.Никитенко, Е.А.Сияновой, О.С.Медведевой, Д.С.Котовой, А.В.Нечаю, Е.Г.Целикиной, сотрудникам Федерального государственного бюджетного учреждения «Научно-исследовательский институт пульмонологии» Федерального медико-биологического агентства России» С.А.Красовскому, И.Н.Бутюгиной и сотруднику Государственного унитарного предприятия Московский городской центр дезинфекции «Дезстанция 6» А.В.Шамису.There was no financial support for the study. The authors express their gratitude for assistance in performing bacteriological assays to Doctor of Medicine, Professor, Academician of RAS Avdeev S.N., and to the employees of the Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F.Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”: Soloviev A.I., Krasnoslobodtsev K.G., Burmistrov E.M., Nikitenko N.A., Siyanova E.A., Medvedeva O.S., Kotova D.S., Nechay A.V., Tselikina E.G., to the employees of the Federal State Budgetary Institution “Pulmonology Scientific Research Institute” under Federal Medical and Biological Agency of Russian Federation Krasovsky S.A., Butyugina I.N. and to the employee of the State Unitary Enterprise Moscow City Disinfection Center “Dezstation 6” Shamis A.V.ReferencesКондратьева Е.И., Авдеев С.Н., Мизерницкий Ю.Л. и др. Первичная цилиарная дискинезия: обзор проекта клинических рекомендаций 2022 года. Пульмонология. 2022; 32 (4): 517–538. DOI: 10.18093/0869-0189-2022–32-4-517-538.Kondratyeva E.I., Avdeev S.N., Mizernitskiy Yu.L. et al. [Primary ciliary dyskinesia: review of the draft clinical guidelines, 2022]. Pul’monologiya. 2022; 32 (4): 517–538. DOI: 10.18093/0869-01892022-32-4-517-538 (in Russian).Богорад А.Е., Дьякова С.Э., Мизерницкий Ю.Л. Первичная цилиарная дискинезия: современные подходы к диагностике и терапии. Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2019; 64 (5): 123–133. DOI: 10.21508/1027-4065-2019-64-5-123-133Bogorad A.E., D’yakova S.E., Mizernitskiy Yu.L. [Primary ciliary dyskinesia: modern approaches to the diagnostics and treatment]. Rossiyskiy vestnik perinatologii i pediatrii. 2019; 64 (5): 123–133. DOI: 10.21508/1027-4065-2019-64-5-123-133 (in Russian).Kuehni C.E, Lucas J.S. Diagnosis of primary ciliary dyskinesia: summary of the ERS Task Force report. Breathe (Sheff.). 2017; 13 (3): 166–178. DOI: 10.1183/20734735.008517.Kuehni C.E, Lucas J.S. Diagnosis of primary ciliary dyskinesia: summary of the ERS Task Force report. Breathe (Sheff.). 2017; 13 (3): 166–178. DOI: 10.1183/20734735.008517.Alanin M.C., Nielsen K.G., von Buchwald C. et al. A longitudinal study of lung bacterial pathogens in patients with primary ciliary dyskinesia. Clin. Microbiol. Infect. 2015; 21 (12): 1093.e1–1093.e7. DOI: 10.1016/j.cmi.2015.08.020.Alanin M.C., Nielsen K.G., von Buchwald C. et al. A longitudinal study of lung bacterial pathogens in patients with primary ciliary dyskinesia. Clin. Microbiol. Infect. 2015; 21 (12): 1093.e1–1093.e7. DOI: 10.1016/j.cmi.2015.08.020.Cohen-Cymberknoh M., Weigert N., Gileles-Hillel A. et al. Clinical impact of pseudomonas aeruginosa colonization in patients with primary ciliary dyskinesia. Respir. Med. 2017; 131: 241–246. DOI: 10.1016/j.rmed.2017.08.028.Cohen-Cymberknoh M., Weigert N., Gileles-Hillel A. et al. Clinical impact of pseudomonas aeruginosa colonization in patients with primary ciliary dyskinesia. Respir. Med. 2017; 131: 241–246. DOI: 10.1016/j.rmed.2017.08.028.Чернуха М.Ю., Шагинян И.А., Жуховицкий В.Г. и др. Применение системы MALDI Biotyper и алгоритма микробиологической диагностики для идентификации неферментирующих микроорганизмов, выделенных из дыхательных путей у больных муковисцидозом. Клиническая микробиология и антимикробная xимиотерапия. 2017; 19 (4): 327–334. Доступно на: https:// cmac-journal.ru/publication/2017/4/cmac-2017-t19-n4-p327/cmac2017-t19-n4-p327.pdfChernukha M.Yu., Shaginyan I.A., Zhukhovitskiy V.G. et al. [Use of the MALDI Biotyper system and the microbiological diagnosis algorithm for identification of non-fermenting bacteria isolated from respiratory tract in cystic fibrosis patients]. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya ximioterapiya. 2017; 19 (4): 327–334. Available at: https://cmac-journal.ru/publication/2017/4/cmac-2017-t19-n4-p327/cmac-2017-t19-n4-p327.pdf (in Russian).Домонова Э.А., Творогова М.Г., Подколзин А.Т. и др. Взятие, транспортировка, хранение биологического материала для ПЦРдиагностики: методические рекомендации. М.; 2021. Доступно на: https://prepcr.crie.ru/docs/Metodicheskie_Rekomendacii.pdfDomonova E.A., Tvorogova M.G., Podkolzin A.T. et al. [Collection, transportation, storage of biological material for PCR diagnostics: methodological recommendations]. Moscow; 2021. Available at: https://prepcr.crie.ru/docs/Metodicheskie_Rekomendacii.pdf (in Russian).Wijers C.D., Chmiel J.F., Gaston B.M. Bacterial infections in patients with primary ciliary dyskinesia: Comparison with cystic fibrosis. Chron. Respir. Dis. 2017; 14 (4): 392–406. DOI: 10.1177/1479972317694621.Wijers C.D., Chmiel J.F., Gaston B.M. Bacterial infections in patients with primary ciliary dyskinesia: Comparison with cystic fibrosis. Chron. Respir. Dis. 2017; 14 (4): 392–406. DOI: 10.1177/1479972317694621.Noone P.G., Leigh M.W., Sannuti A. et al. Primary ciliary dyskinesia: diagnostic and phenotypic features. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2004; 169 (4): 459–467. DOI: 10.1164/rccm.200303-365OC.Noone P.G., Leigh M.W., Sannuti A. et al. Primary ciliary dyskinesia: diagnostic and phenotypic features. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2004; 169 (4): 459–467. DOI: 10.1164/rccm.200303-365OC.Бурмистров Е.М., Краснослободцев К.Г., Аветисян Л.Р. и др. Смешанные бактериально-вирусные инфекции легких у пациентов с муковисцидозом. Пульмонология. 2023; 33 (4): 488–496. DOI: 10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496.Burmistrov E.M., Krasnoslobodtsev K.G., Avetisyan L.R. et al. [Mixed bacterial-viral lung infections in patients with cystic fibrosis]. Pul’monologiya. 2023; 33 (4): 488–496. DOI: 10.18093/0869-01892023 33-4-488-496 (in Russian).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.