pulmoПульмонологияPULMONOLOGIYA0869-01892541-9617Scientific and Practical Journal “PULMONOLOGIYA” LLC10.18093/0869-0189-2023-33-5-645-656pulmo-4306Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL STUDIESСостав бактериального микробиома мокроты у пациентов с ограниченными формами туберкулеза легкихComposition of bacterial microbiome in sputum of patients with localized forms of pulmonary tuberculosishttps://orcid.org/0000-0002-5534-2062ДружининВ. Г.DruzhininV. G.

Дружинин Владимир Геннадьевич – д. б. н., профессор, профессор кафедры генетики и фундаментальной медицины Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Кемеровский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации; старший научный сотрудник проблемной научно-исследовательской лаборатории Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации

650000, Кемерово, ул. Красная, 6; 650056, Кемерово, ул. Ворошилова, 22А

тел.: (3842) 58-01-66

Vladimir G. Druzhinin, Doctor of Biology, Professor, Professor of the Department of Genetics and Fundamental Medicine, Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education “Kemerovo State University”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation; Senior Researcher, Problem Research Laboratory, Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education “Kemerovo State Medical University”, Ministry of Health of the Russian Federation

ul. Krasnaya 6, Kemerovo, 650000; ul. Voroshilova 22A, Kemerovo, 650056

tel.: (3842) 58-01-66

druzhinin_vladim@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9503-8500БарановаЕ. Д.BaranovaE. D.

Баранова Елизавета Дмитриевна – магистрант кафедры генетики и фундаментальной медицины

650000, Кемерово, ул. Красная, 6

тел.: (3842) 58-01-66

Elizaveta D. Baranova, Master’s student, Department of Genetics and Fundamental Medicine

ul. Krasnaya 6, Kemerovo, 650000

tel.: (3842) 58-01-66

laveivana@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9433-8341ДеменковП. С.DemenkovP. S.

Деменков Павел Сергеевич – к. т. н., доцент кафедры дискретной математики и информатики

630090, Новосибирск, ул. Пирогова, 1

тел.: (923) 240-95-42

Pavel S. Demenkov, Candidate of Engineering, Associate Professor, Department of Discrete Mathematics and Computer Science

ul. Pirogova 1, Novosibirsk, 630090

tel.: (923) 240-95-42

demps@bionet.nsc.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3475-9125ЗахароваЮ. В.ZakharovaJu. V.

Захарова Юлия Викторовна – д. м. н., профессор кафедры микробиологии и вирусологии

650056, Кемерово, ул. Ворошилова, 22А

тел.: (3842) 73-28-71

Yulia V. Zakharova, Doctor of Medicine, Professor, Department of Microbiology and Virology

ul. Voroshilova 22A, Kemerovo, 650056

tel.: (3842) 73-28-71

yvz@bk.ruhttps://orcid.org/0000-0003-1593-0676ЛавряшинаМ. Б.LavryashinaM. B.

Лавряшина Мария Борисовна – д. б. н. заведующий кафедрой молекулярной и клеточной биологии

650056, Кемерово, ул. Ворошилова, 22А

тел.: (905) 960-94-47

Maria B. Lavryashina, Doctor of Biology, Head of Department of Molecular and Cellular Biology

ul. Voroshilova 22A, Kemerovo, 650056

tel.: (905) 960-94-47

lmb2001@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7974-6483ЛарионовА. В.LarionovA. V.

Ларионов Алексей Викторович – к. б. н., доцент кафедры генетики и фундаментальной медицины

650000, Кемерово, ул. Красная, 6

тел.: (3842) 58-01-66

Alexei V. Larionov, Candidate of Biology, Associate Professor, Department of Genetics and Fundamental Medicine

ul. Krasnaya 6, Kemerovo, 650000

tel.: (3842) 58-01-66

larionov@kemsu.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3174-1560МацковаЛ. В.MatskovaL. V.

Мацкова Людмила Валентиновна – PhD, исследователь департамента микробиологии и клеточной биологии Каролинского института – медицинского университета

17165, Стокгольм, Солнавэген, 9

тел.: (46733) 633-89-54

Liudmila V. Matskova, PhD, Affiliated Researcher, Department of Microbiology and Tumor Biology

Solnavägen 9, Stockholm, 17165, Sweden

 tel.: (46733) 633-89-54

liudmila.matskova@ki.sehttps://orcid.org/0000-0002-8785-7896ШабалдинА. В.ShabaldinA. V.

Шабалдин Андрей Владимирович – д. м. н., доцент, профессор кафедры генетики и фундаментальной медицины

650000, Кемерово, ул. Красная, 6

тел.: (3842) 90-09-22

Andrey V. Shabaldin, Doctor of Medicine, Associate Professor, Professor of the Department of Genetics and Fundamental Medicine

ul. Krasnaya 6, Kemerovo, 650000

tel.: (3842) 90-09-22

weit2007@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-4854-5734ПьянзоваТ. В.PyanzovaT. V.

Пьянзова Татьяна Владимировна – д. м. н., заведующий кафедрой фтизиатрии

650056, Кемерово, ул. Ворошилова, 22А

тел.: (3842) 54-56-51

Tatyana V. Pyanzova, Doctor of Medicine, Head of the Department of Phthisiology

ul. Voroshilova 22A, Kemerovo, 650056

tel.: (3842) 54-56-51

tatyana_vezhnina@mail.ruФедеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кемеровский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации; Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияFederal State Budgetary Educational Institution of Higher Education “Kemerovo State University”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation; Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education “Kemerovo State Medical University”, Ministry of Health of the Russian FederationRussian FederationФедеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кемеровский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской ФедерацииРоссияFederal State Budgetary Educational Institution of Higher Education “Kemerovo State University”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian FederationRussian FederationФедеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской ФедерацииРоссияFederal State Autonomous Educational Institution of Higher Education “Novosibirsk State University”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian FederationRussian FederationФедеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияFederal State Budgetary Educational Institution of Higher Education “Kemerovo State Medical University”, Ministry of Health of the Russian FederationRussian FederationКаролинский институт – медицинский университетШвецияKarolinska Institutet – a Medical UniversitySweden202306092023335645656Copyright © Дружинин В.Г., Баранова Е.Д., Деменков П.С., Захарова Ю.В., Лавряшина М.Б., Ларионов А.В., Мацкова Л.В., Шабалдин А.В., Пьянзова Т.В., 20232023Дружинин В.Г., Баранова Е.Д., Деменков П.С., Захарова Ю.В., Лавряшина М.Б., Ларионов А.В., Мацкова Л.В., Шабалдин А.В., Пьянзова Т.В.Druzhinin V.G., Baranova E.D., Demenkov P.S., Zakharova J.V., Lavryashina M.B., Larionov A.V., Matskova L.V., Shabaldin A.V., Pyanzova T.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.pulmonology.ru/pulm/article/view/4306

По данным исследований последних лет показано, что бактериальный микробиом респираторного тракта имеет влияние на развитие туберкулеза легких (ТЛ). Изменение состава микробиома у пациентов связано с особенностями патогенеза инфекции Mycobacterium tuberculosis, реакции на терапию и клинических исходов заболевания. До настоящего времени состав респираторного микробиома у больных с ограниченными формами ТЛ остается неизученным. Материалы и методы. С использованием технологии секвенирования (NGS) региона V3–V4 бактериального гена, кодирующего 16S рРНК, проанализирован таксономический состав микробиома мокроты у пациентов (n = 14) с ограниченными формами ТЛ (туберкулемами) и здоровых доноров (n = 14) группы сравнения. Результаты. Установлено, что микробиомы мокроты у пациентов обеих сравниваемых групп не имели значимых различий по индексу видового богатства (Шеннона), однако наблюдалось снижение другого параметра альфа-разнообразия – индекса равномерности. Структуры бактериальных сообществ (бета-разнообразие) между больными с ограниченными формами ТЛ и здоровыми субъектами не имели значимых различий. У пациентов с ограниченными формами ТЛ на фоне снижения содержания в мокроте представителей типов Fusobacteria, TM7, Tenericutes, Spirochaetes и SR1, а также родов Dialister, Mycoplasma и Filifactor не наблюдалось явного доминирования какого-либо таксона бактерий. Заключение. Для дальнейшего понимания роли микробиоты мокроты в развитии ограниченных форм ТЛ требуется подтверждение результатами независимых крупномасштабных исследований определенных параметров альфа- и бета-разнообразия, характеризующих микробиом мокроты у пациентов с ограниченными формами ТЛ. Определение титров Prevotella в мокроте у этих больных перспективно для диагностики локализованных форм ТЛ и поиска их геномных маркеров.  

Recent studies have shown that the respiratory bacterial microbiome has an impact on the development of pulmonary tuberculosis. Changes in the composition of the microbiome have been associated with the pathogenesis of Mycobacterium tuberculosis infection, response to therapy, and clinical outcomes of the disease. To date, the composition of the respiratory microbiome has not been studied in patients with localized forms of pulmonary tuberculosis. Methods. In the present study, the taxonomic composition of the sputum microbiome of 14 patients with localized forms of pulmonary tuberculosis (tuberculomas) and 14 healthy donors in the comparison group was analyzed by sequencing (NGS) of the V3 – V4 region of the bacterial gene encoding 16S rRNA. Results. The sputum microbiomes of the patients and the control group did not have significant differences in the species richness index (Shannon). However, the patients showed a decrease in the uniformity index, another parameter of alpha diversity. Bacterial community structures (beta diversity) did not differ significantly between patients with localized forms of tuberculosis and healthy subjects. In patients with limited forms of tuberculosis, contrary to the decrease in the content of representatives of the phyla Fusobacteria, TM7, Tenericutes, Spirochaetes, and SR1, and of the genera Dialister, Mycoplasma, and Filifactor in the sputum, no clear dominance of any bacterial taxon was observed. Conclusion. Certain alpha and beta diversity parameters that characterize the sputum microbiome of patients with localized forms of pulmonary tuberculosis need to be confirmed in independent large-scale studies to further understand the role of the sputum microbiota in the development of localized forms of pulmonary tuberculosis. Determination of Prevotella titers in the sputum of these patients holds promise for the diagnosis of localized forms of pulmonary tuberculosis and the search for their genomic markers.

туберкулез легкоготуберкулемыбактериальный микробиоммокротатаксономический состав16S рРНКNGS-секвенированиеpulmonary tuberculosistuberculomasbacterial microbiomesputumtaxonomic composition16S rRNANGS sequencingРабота выполнена при финансовой поддержке государственного задания Министерства здравоохранения Российской Федерации (соглашение № 056-03-2023-050).The work was supported by the state assignment of the Ministry of Health of the Russian Federation (Agreement No.056-03-2023-050).ReferencesWorld Health Organization. Global tuberculosis report 2021. Available at: https://www.who.int/publications/i/item/9789240037021World Health Organization. Global tuberculosis report 2021. Available at: https://www.who.int/publications/i/item/9789240037021World Health Organization. WHO end TB strategy. Global strategy and targets for tuberculosis prevention, care and control after 2015. Available at: https://www.who.int/publications/i/item/WHO-HTM-TB-2015.19 [Accessed: May 23, 2016].World Health Organization. WHO end TB strategy. Global strategy and targets for tuberculosis prevention, care and control after 2015. Available at: https://www.who.int/publications/i/item/WHO-HTM-TB-2015.19 [Accessed: May 23, 2016].Васильева И.А., Тестов В.В., Стерликов С.А. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в годы пандемии COVID-19 – 2020–2021 гг. Туберкулез и болезни легких. 2022; 100 (3): 6–12. DOI: 10.21292/2075-1230-2022-100-3-6-12.Vasilyeva I.A., Testov V.V., Sterlikov S.A. [Tuberculosis situation in the years of the COVID-19 pandemic – 2020–2021]. Tuberkulez i bolezni legkikh. 2022; 100 (3): 6–12. DOI: 10.21292/2075-1230-2022-100-3-6-12 (in Russian).Moschos S.A., Williams A.E., Perry M.M. et al. Expression profiling in vivo demonstrates rapid changes in lung microRNA levels following lipopolysaccharide-induced inflammation but not in the anti-inflammatory action of glucocorticoids. BMC Genomics. 2007; 8: 240. DOI: 10.1186/1471-2164-8-240.Moschos S.A., Williams A.E., Perry M.M. et al. Expression profiling in vivo demonstrates rapid changes in lung microRNA levels following lipopolysaccharide-induced inflammation but not in the anti-inflammatory action of glucocorticoids. BMC Genomics. 2007; 8: 240. DOI: 10.1186/1471-2164-8-240.Еремеев В.В., Евстифеев В.В., Шепелькова Г.С. и др. МикроРНК и туберкулез. Инфекция и иммунитет. 2018; 8 (3): 309–315. DOI: 10.15789/2220-7619-2018-3-309-315.Eremeev V.V., Evstifeev V.V., Shepelkova G.S. et al. MicroRNA and tuberculosis. Infektsiya i immunitet. 2018; 8 (3): 309–315. DOI: 10.15789/2220-7619-2018-3-309-315 (in Russian).Гуськов А.М., Шепелькова Г.С., Эргешова А.Э. Перспектива использования сывороточных микроРНК в качестве маркеров распада у больных туберкулезом с диагнозом туберкулемы легкого. Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза. 2019; (Прил. 1): 13. DOI: 10.7868/S2587667819050029.Gus'kov A.M., Shepel'kova G.S., Jergeshova A.Je. [Prospects for the use of serum microRNAs as decay markers in tuberculosis patients diagnosed with pulmonary tuberculoma]. Vestnik Central'nogo nauchno-issledovatel'skogo instituta tuberkuleza. 2019; (Suppl. 1): 13. DOI: 10.7868/S2587667819050029 (in Russian).Wood M.R., Yu E.A., Mehta S. The human microbiome in the fight against tuberculosis. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2017; 96 (6): 1274–1284. DOI: 10.4269/ajtmh.16-0581.Wood M.R., Yu E.A., Mehta S. The human microbiome in the fight against tuberculosis. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2017; 96 (6): 1274–1284. DOI: 10.4269/ajtmh.16-0581.Eshetie S., van Soolingen D. The respiratory microbiota: new insights into pulmonary tuberculosis. BMC Infect. Dis. 2019; 19 (1): 92. DOI: 10.1186/s12879-019-3712-1.Eshetie S., van Soolingen D. The respiratory microbiota: new insights into pulmonary tuberculosis. BMC Infect. Dis. 2019; 19 (1): 92. DOI: 10.1186/s12879-019-3712-1.Ticlla M.R., Hella J., Hiza H. et al. The sputum microbiome in pulmonary tuberculosis and its association with disease manifestations: a cross-sectional study. Front. Microbiol. 2021; 12: 633396. DOI: 10.3389/fmicb.2021.633396.Ticlla M.R., Hella J., Hiza H. et al. The sputum microbiome in pulmonary tuberculosis and its association with disease manifestations: a cross-sectional study. Front. Microbiol. 2021; 12: 633396. DOI: 10.3389/fmicb.2021.633396.Barbosa-Amezcua M., Galeana-Cadena D., Alvarado-Peña N., Silva-Herzog E. The microbiome as part of the contemporary view of tuberculosis disease. Pathogens. 2022; 11 (5): 584. DOI: 10.3390/pathogens11050584.Barbosa-Amezcua M., Galeana-Cadena D., Alvarado-Peña N., Silva-Herzog E. The microbiome as part of the contemporary view of tuberculosis disease. Pathogens. 2022; 11 (5): 584. DOI: 10.3390/pathogens11050584.Bolyen E., Rideout J.R., Dillon M.R. et al. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nat. Biotechnol. 2019; 37 (8): 852–857. DOI: 10.1038/s41587-019-0209-9.Bolyen E., Rideout J.R., Dillon M.R. et al. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nat. Biotechnol. 2019; 37 (8): 852–857. DOI: 10.1038/s41587-019-0209-9.Lozupone C., Knight R. UniFrac: a new phylogenetic method for comparing microbial communities. Appl. Environ. Microbiol. 2005; 71 (12): 8228–8235. DOI: 10.1128/AEM.71.12.8228-8235.2005.Lozupone C., Knight R. UniFrac: a new phylogenetic method for comparing microbial communities. Appl. Environ. Microbiol. 2005; 71 (12): 8228–8235. DOI: 10.1128/AEM.71.12.8228-8235.2005.Segata N., Izard J., Waldron L. et al. Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biol. 2011; 12 (6): R60. DOI: 10.1186/gb-2011-12-6-r60.Segata N., Izard J., Waldron L. et al. Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biol. 2011; 12 (6): R60. DOI: 10.1186/gb-2011-12-6-r60.Dickson R.P., Erb-Downward J.R., Martinez F.J., Huffnagle G.B. The microbiome and the respiratory tract. Annu. Rev. Physiol. 2016; 78: 481–504. DOI: 10.1146/annurev-physiol-021115-105238.Dickson R.P., Erb-Downward J.R., Martinez F.J., Huffnagle G.B. The microbiome and the respiratory tract. Annu. Rev. Physiol. 2016; 78: 481–504. DOI: 10.1146/annurev-physiol-021115-105238.Krishna P., Jain A., Bisen P.S. Microbiome diversity in the sputum of patients with pulmonary tuberculosis. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect Dis. 2016; 35 (7): 1205–1210. DOI: 10.1007/s10096-016-2654-4.Krishna P., Jain A., Bisen P.S. Microbiome diversity in the sputum of patients with pulmonary tuberculosis. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect Dis. 2016; 35 (7): 1205–1210. DOI: 10.1007/s10096-016-2654-4.Dickson R.P., Huffnagle G.B. The lung microbiome: new principles for respiratory bacteriology in health and disease. PLoS Pathog. 2015; 11 (7): e1004923. DOI: 10.1371/journal.ppat.1004923.Dickson R.P., Huffnagle G.B. The lung microbiome: new principles for respiratory bacteriology in health and disease. PLoS Pathog. 2015; 11 (7): e1004923. DOI: 10.1371/journal.ppat.1004923.Wang J., Li F., Tian Z. Role of microbiota on lung homeostasis and diseases. Sci. China Life Sci. 2017; 60 (12): 1407–1415. DOI: 10.1007/s11427-017-9151-1.Wang J., Li F., Tian Z. Role of microbiota on lung homeostasis and diseases. Sci. China Life Sci. 2017; 60 (12): 1407–1415. DOI: 10.1007/s11427-017-9151-1.Ryndak M.B., Laal S. Mycobacterium tuberculosis primary infection and dissemination: a critical role for alveolar epithelial cells. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2019; 9: 299. DOI: 10.3389/fcimb.2019.00299.Ryndak M.B., Laal S. Mycobacterium tuberculosis primary infection and dissemination: a critical role for alveolar epithelial cells. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2019; 9: 299. DOI: 10.3389/fcimb.2019.00299.Simmons J.D., Stein C.M., Seshadri C. et al. Immunological mechanisms of human resistance to persistent Mycobacterium tuberculosis infection. Nat. Rev. Immunol. 2018; 18 (9): 575–589. DOI: 10.1038/s41577-018-0025-3.Simmons J.D., Stein C.M., Seshadri C. et al. Immunological mechanisms of human resistance to persistent Mycobacterium tuberculosis infection. Nat. Rev. Immunol. 2018; 18 (9): 575–589. DOI: 10.1038/s41577-018-0025-3.Cui Z., Zhou Y., Li H. et al. Complex sputum microbial composition in patients with pulmonary tuberculosis. BMC Microbiol. 2012; 12: 276. DOI: 10.1186/1471-2180-12-276.Cui Z., Zhou Y., Li H. et al. Complex sputum microbial composition in patients with pulmonary tuberculosis. BMC Microbiol. 2012; 12: 276. DOI: 10.1186/1471-2180-12-276.Hu Y., Kang Y., Liu X. et al. Distinct lung microbial community states in patients with pulmonary tuberculosis. Sci. China Life Sci. 2020; 63 (10): 1522–1533. DOI: 10.1007/s11427-019-1614-0.Hu Y., Kang Y., Liu X. et al. Distinct lung microbial community states in patients with pulmonary tuberculosis. Sci. China Life Sci. 2020; 63 (10): 1522–1533. DOI: 10.1007/s11427-019-1614-0.Cheung M.K., Lam W.Y., Fung W.Y. et al. Sputum microbiota in tuberculosis as revealed by 16S rRNA pyrosequencing. PLoS One. 2013; 8 (1): e54574. DOI: 10.1371/journal.pone.0054574.Cheung M.K., Lam W.Y., Fung W.Y. et al. Sputum microbiota in tuberculosis as revealed by 16S rRNA pyrosequencing. PLoS One. 2013; 8 (1): e54574. DOI: 10.1371/journal.pone.0054574.Wu J., Liu W., He L. et al. Sputum microbiota associated with new, recurrent and treatment failure tuberculosis. PLoS ONE. 2013; 8 (12): e83445. DOI: 10.1371/journal.pone.0083445.Wu J., Liu W., He L. et al. Sputum microbiota associated with new, recurrent and treatment failure tuberculosis. PLoS ONE. 2013; 8 (12): e83445. DOI: 10.1371/journal.pone.0083445.Рыжова Н.Н., Воронина О.Л., Лосева Э.В. и др. Микробиом респираторного тракта детей с муковисцидозом. Сибирское медицинское обозрение. 2019; (2): 19–28. DOI: 10.20333/2500136-2019-2-19-28.Ryzhova N.N., Voronina O.L., Loseva E.V. et al. [Respiratory tract microbiome in children with cystic fibrosis]. Sibirskoe meditsinskoe obozrenie. 2019; (2): 19–28. DOI: 10.20333/2500136-2019-2-19-28 (in Russian).Шабалдин А.В., Шабалдина Е.В., Симбирцев А.С. Особенности микробиома верхних отделов респираторного тракта у детей с рецидивирующими респираторными заболеваниями. Инфекция и иммунитет. 2017; 7 (4): 341–349. DOI: 10.15789/2220-7619-2017-4-341-349.Shabaldin A.V., Shabaldina E.V., Simbirtsev A.S. [Features of the microbiome of the upper respiratory tract in children with recurrent respiratory diseases]. Infektsiya i immunitet. 2017; 7 (4): 341–349. DOI: 10.15789/2220-7619-2017-4-341-349 (in Russian).Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature. 2012; 486 (7402): 201–214. DOI: 10.1038/nature11234.Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature. 2012; 486 (7402): 201–214. DOI: 10.1038/nature11234.Biesbroek G., Tsivtsivadze E., Sanders E.A. et al. Early respiratory microbiota composition determines bacterial succession patterns and respiratory health in children. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2014; 190 (11): 1283–1292. DOI: 10.1164/rccm.201407-1240OC.Biesbroek G., Tsivtsivadze E., Sanders E.A. et al. Early respiratory microbiota composition determines bacterial succession patterns and respiratory health in children. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2014; 190 (11): 1283–1292. DOI: 10.1164/rccm.201407-1240OC.Luo M., Liu Y., Wu P. et al. Alternation of gut microbiota in patients with pulmonary tuberculosis. Front. Physiol. 2017; 8: 822. DOI: 10.3389/fphys.2017.00822.Luo M., Liu Y., Wu P. et al. Alternation of gut microbiota in patients with pulmonary tuberculosis. Front. Physiol. 2017; 8: 822. DOI: 10.3389/fphys.2017.00822.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.