<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">pulmo</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Пульмонология</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>PULMONOLOGIYA</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">0869-0189</issn><issn pub-type="epub">2541-9617</issn><publisher><publisher-name>Scientific and Practical Journal “PULMONOLOGIYA” LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">pulmo-4200</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL STUDIES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Смешанные бактериально-вирусные инфекции легких у пациентов с муковисцидозом</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Mixed bacterial-viral lung infections in patients with cystic fibrosis</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6592-8331</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Бурмистров</surname><given-names>Е. М.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Burmistrov</surname><given-names>E. M.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Бурмистров Егор Михайлович - научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Egor M. Burmistrov - Researcher, Laboratory of Molecular Epidemiology of Nosocomial Infections, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">chetusha2006@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-1745-9128</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Краснослободцев</surname><given-names>К. Г.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Krasnoslobodtsev</surname><given-names>K. G.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Краснослободцев Кирилл Геннадьевич - научный сотрудник лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Kirill G. Krasnoslobodtsev - Researcher, Laboratory of Etiology and Epidemiology of Influenza, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">kkg_87@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9053-2515</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Аветисян</surname><given-names>Л. Р.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Avetisyan</surname><given-names>L. R.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Аветисян Лусине Ремуальдовна – доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Lusine R. Avetisyan - Doctor of Medicine, Leading Researcher, Laboratory of Epidemiology of Nosocomial Infections, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">lusavr@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3826-3733</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сиянова</surname><given-names>Е. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Siyanova</surname><given-names>E. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Сиянова Екатерина Алексеевна — младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Ekaterina A. Siyanova - Junior Researcher, Laboratory of Epidemiology of Nosocomial Infections, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">hal-katy@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-1988-7775</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Медведева</surname><given-names>О. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Medvedeva</surname><given-names>O. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Медведева Ольга Сергеевна — младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Olga S. Medvedeva - Junior Researcher, Laboratory of Epidemiology of Nosocomial Infections, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">olgamedw.olga@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7070-9272</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Целикина</surname><given-names>Е. Г.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Tselikina</surname><given-names>E. G.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Целикина Евгения Геннадьевна — младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии госпитальных инфекций.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Eugenia G. Tselikina - Junior Researcher, Laboratory of Epidemiology of Nosocomial Infections,, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">geshka90@mail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1647-5815</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Поляков</surname><given-names>Н. Б.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Polyakov</surname><given-names>N. B.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Поляков Никита Борисович — научный сотрудник лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 190-74-22</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Nikita B. Polyakov - Researcher, Laboratory of Indication and Ultrastructur-al Analysis of Microorganisms, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 190-74-22</p></bio><email xlink:type="simple">polyakovnb@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7389-6157</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Соловьев</surname><given-names>А. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Solovyev</surname><given-names>A. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Соловьев Андрей Иванович — доктор биологических наук, научный сотрудник лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 190-74-22</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Andrey I. Solovyev - Doctor of Biology, Researcher, Laboratory of Indication and Ultrastructural Analysis of Microorganisms, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F.Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 190-74-22</p></bio><email xlink:type="simple">dronnias@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-8183-7990</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Воронкова</surname><given-names>А. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Voronkova</surname><given-names>A. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Воронкова Анна Юрьевна — кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник научно-клинического отдела муковисцидоза ФГБНУ «МГНЦ им. ак. Н.П. Бочкова» Министерства науки и высшего образования РФ; врач-педиатр отделения муковисцидоза ГБУЗ МО «НИКИ детства МЗ Московской области».</p><p>115522, Москва, ул. Москворечье, 1; 115093, Москва, ул. Большая Серпуховская, 62</p><p>тел.: (495) 111-03-03</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Anna Yu. Voronkova - Candidate of Medicine, Leading Researcher, Scientific and Clinical Department of Cystic Fibrosis, Federal State Budgetary Scientific Institution “Research Centre for Medical Genetics”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation; Pediatrician, Department of Cystic Fibrosis, Moscow Region State Budgetary Healthcare Institution “Research Clinical Institute of Childhood, Ministry of Health of the Moscow Region”.</p><p>Moskvorechye ul. 1, Moscow, 115522; Bolshaya Serpukhovskaya ul. 62, Moscow, 115093</p><p>tel.: (495) 111-03-03</p></bio><email xlink:type="simple">voronkova111@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-6395-0407</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кондратьева</surname><given-names>Е. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kondratyeva</surname><given-names>E. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Кондратьева Елена Ивановна — доктор медицинских наук, профессор, руководитель научно-клинического отдела муковисцидоза ФГБНУ «МГНЦ им. ак. Н.П. Бочкова» Министерства науки и высшего образования РФ; заместитель директора по науке ГБУЗ МО «НИКИ детства МЗ МО».</p><p>115522, Москва, ул. Москворечье, 1; 115093, Москва, ул. Большая Серпуховская, 62</p><p>тел.: (495) 111-03-03</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena I. Kondratyeva - Doctor of Medicine, Professor, Head of the Scientific and Clinical Department of cystic fibrosis, Federal State Budgetary Scientific Institution “Research Centre for Medical Genetics”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation; Deputy Director for Science, Moscow Region State Budgetary Healthcare Institution “Research Clinical Institute of Childhood, Ministry of Health of the Moscow Region”.</p><p>Moskvorechye ul. 1, Moscow, 115522; Bolshaya Serpukhovskaya ul. 62, Moscow, 115093</p><p>tel.: (495) 111-03-03</p></bio><email xlink:type="simple">elenafpk@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9642-0947</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Красовский</surname><given-names>С. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Krasovskiy</surname><given-names>S. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Красовский Станислав Александрович — кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории муковисцидоза.</p><p>115682, Москва, Ореховый бульвар, 28</p><p>тел: (495) 965-23-24</p><p>Author ID: 688178</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Stanislav А. Krasovskiy - Candidate of Medicine, Senior Researcher, Cystic Fibrosis Laboratory, Federal State Budgetary Institution “Pulmonology Scientific Research Institute” under Federal Medical and Biological Agency of Russian Federation; Leading Researcher.</p><p>Orekhovyy bul’var 28, Moscow, 115682</p><p>tel.: (495) 965-23-24</p><p>Author ID: 688178</p></bio><email xlink:type="simple">sa_krasovsky@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4653-2446</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Жуховицкий</surname><given-names>В. Г.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zhukhovitsky</surname><given-names>V. G.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Жуховицкий Владимир Григорьевич — кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов ФГБУ «НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» МЗ РФ; доцент кафедры биохимии и иммунопатологии ФГБОУ ДПО «РМАНПО» МЗ РФ.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18; 125993, Москва, ул. Баррикадная, 2 / 1, стр. 1</p><p>тел.: (499) 193-43-76</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vladimir G. Zhukhovitsky - Candidate of Medicine, Head of the Laboratory of Indication and Ultrastructural Analysis of Microorganisms, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”; Associate Professor, Department of Biochemistry and Immunopathology, Federal State Budgetary Educational Institution of Additional Professional Education “Russian Medical Academy of Continuous Professional Education”, Ministry of Health of Russia.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098; Barrikadnaya ul. 2/1, Moscow, 123995</p><p>tel.: (499) 193-43-76</p></bio><email xlink:type="simple">zhukhovitsky@rambler.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-2518-6801</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Бурцева</surname><given-names>Е. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Burtseva</surname><given-names>E. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Бурцева Елена Ивановна — доктор медицинских наук руководитель, ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena I. Burtseva - Doctor of Medicine, Head of Laboratory of Etiology and Epidemiology of Influenza, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">elena-burtseva@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-5"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-5829-744X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Никитенко</surname><given-names>Н. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Nikitenko</surname><given-names>N. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Никитенко Наталья Анатольевна — кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории клеточной микробиологии, заведующая медицинским отделом.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-55-94</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Natalia A. Nikitenko - Candidate of Biology, Senior Researcher at Cell Microbiology Laboratory, Head of the Medical Department, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul.18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-55-94</p></bio><email xlink:type="simple">nanthalia@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-5"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-2349-8556</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Чернуха</surname><given-names>М. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Chernukha</surname><given-names>M. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Чернуха Марина Юрьевна — доктор медицинских наук, заведующая лабораторией эпидемиологии госпитальных инфекций.</p><p>123098, Москва, ул. Гамалеи, 18</p><p>тел.: (499) 193-61-17</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Marina Yu. Chernukha - Doctor of Medicine, Head of the Laboratory of Epidemiology of Nosocomial Infections, Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F.Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”.</p><p>Gamaleya ul. 18, Moscow, 123098</p><p>tel.: (499) 193-61-17</p></bio><email xlink:type="simple">chernukha@gamaleya.org</email><xref ref-type="aff" rid="aff-5"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации; Государственное бюджетное учреждение здравоохранения Московской области «Научно-исследовательский клинический институт детства Министерства здравоохранения Московской области»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Federal State Budgetary Scientific Institution “Research Centre for Medical Genetics”, Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation; Moscow Region State Budgetary Healthcare Institution “Research Clinical Institute of Childhood, Ministry of Health of the Moscow Region”</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru"><institution>Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-исследовательский институт пульмонологии» Федерального медико-биологического агентства России</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Federal State Budgetary Institution “Pulmonology Scientific Research Institute” under Federal Medical and Biological Agency of Russian Federation</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-4"><aff xml:lang="ru"><institution>Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации; Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”; Federal State Budgetary Educational Institution of Additional Professional Education “Russian Medical Academy of Continuous Professional Education”, Ministry of Health of Russia</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-5"><aff xml:lang="ru"><institution>Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф.Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Federal Government Budgetary Institution “National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Ministry of Health of the Russian Federation”</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>23</day><month>05</month><year>2023</year></pub-date><volume>33</volume><issue>4</issue><fpage>488</fpage><lpage>496</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Бурмистров Е.М., Краснослободцев К.Г., Аветисян Л.Р., Сиянова Е.А., Медведева О.С., Целикина Е.Г., Поляков Н.Б., Соловьев А.И., Воронкова А.Ю., Кондратьева Е.И., Красовский С.А., Жуховицкий В.Г., Бурцева Е.И., Никитенко Н.А., Чернуха М.Ю., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Бурмистров Е.М., Краснослободцев К.Г., Аветисян Л.Р., Сиянова Е.А., Медведева О.С., Целикина Е.Г., Поляков Н.Б., Соловьев А.И., Воронкова А.Ю., Кондратьева Е.И., Красовский С.А., Жуховицкий В.Г., Бурцева Е.И., Никитенко Н.А., Чернуха М.Ю.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Burmistrov E.M., Krasnoslobodtsev K.G., Avetisyan L.R., Siyanova E.A., Medvedeva O.S., Tselikina E.G., Polyakov N.B., Solovyev A.I., Voronkova A.Y., Kondratyeva E.I., Krasovskiy S.A., Zhukhovitsky V.G., Burtseva E.I., Nikitenko N.A., Chernukha M.Y.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journal.pulmonology.ru/pulm/article/view/4200">https://journal.pulmonology.ru/pulm/article/view/4200</self-uri><abstract><p>Основной причиной смерти больных муковисцидозом (МВ) являются инфекционные процессы в легких, в частности, хронические инфекции легких (ХИЛ), вызываемые различными возбудителями, среди которых выявлены доминирующие, чаще всего в виде смешанного инфицирования, – бактериями, грибами, вирусами. Данные о смешанных бактериальных и бактериально-вирусных инфекциях (БВИ), полученных из отечественных и зарубежных источников, фрагментарны и немногочисленны. В настоящее время доминирующие ассоциации возбудителей бактериальной и вирусной природы у пациентов с МВ изучены недостаточно, отсутствуют данные об их эпидемиологической значимости. Целью работы являлась оценка распространенности БВИ и обоснование необходимости разработки системы вирусологического мониторинга у пациентов с МВ. Материалы и методы. Материалом для исследования послужили биоматериалы, полученные из дыхательных путей детей (n = 409) и взрослых (n = 160) больных МВ, обследованных в 2006–2022 гг. Исследование проводилось с помощью бактериологических, молекулярно-генетических методов (полимеразная цепная реакция (ПЦР) в режиме реального времени (РВ) с обратной транскрипцией; времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-ассоциированной лазерной десорбцией / ионизацией (Matrix-Assisted Laser Desorption / Ionization (MALDI) Time-Of-Flight (TOF)). Результаты. Показано, что микрофлора дыхательных путей у пациентов с МВ в 2/3 случаев является смешанной. Микрофлора легких у детей с МВ представляет собой динамичное сообщество микроорганизмов, характеризуемых большим разнообразием и изменчивостью. У взрослых больных ассоциации микроорганизмов встречаются чаще, чем у детей, но менее разнообразен состав ассоциаций. От выборки взрослых больных выделены около 40 видов бактерий (от детей – &gt; 85 видов), среди который преобладали неферментирующие грамотрицательные микроорганизмы: Burkholderia cepacia complex, Pseudomonas aeruginosa, Achromobacter xylosoxidans, Achromobacter ruhlandii, Stenotrophomonas maltophilia, а также Staphylococcus aureus, Candida albicans и Aspergillus spp. По результатам ПЦР РВ показано наличие РНК риновируса в 10 % образцов, полученных от детей, и 12,9 % – от взрослых пациентов с МВ. Заключение. По результатам исследования обоснована необходимость постоянного мониторинга микрофлоры легких у больных МВ, включая исследование на вирусы.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The main cause of death in patients with cystic fibrosis (CF) is infectious process in the lungs, in particular, chronic lung infections caused by various pathogens, most often a combination of bacteria, fungi, or viruses. Data on mixed bacterial and viral-bacterial infections from domestic and foreign sources are fragmentary and sparse. The dominant associations of bacterial and viral pathogens in patients with cystic fibrosis have not been studied properly, and data on their epidemiological significance are lacking. The aim of this study was to assess the prevalence of bacterial and viral infections in patients with cystic fibrosis and to substantiate the need for the development of virological monitoring. Methods. Biomaterials from the respiratory tract of CF patients (409 children and 160 adults with CF) examined from 2006 to 2022 were used. The study was carried out using bacteriological methods, molecular genetic methods (RT-PCR) and MALDI-TOF mass-spectrometry. Results. Microflora of the respiratory tract was shown to be mixed in 2/3 patients with CF. The microflora of the lungs of children with CF is a dynamic community of microorganisms with high diversity and variability. In adult patients, associations of microorganisms are more common than in children, but the composition of associations is less diverse. We isolated about 40 species of bacteria from adult patients and more than 85 species from children in our sample. NFMO prevailed, including Burkholderia cepacia complex, Pseudomonas aeruginosa, Achromobacter xylosoxidans, Achromobacter ruhlandii, Stenotrophomonas maltophilia, and Staphylococcus aureus, Candida albicans, Aspergillus spp. Real-time PCR showed the presence of rhinovirus RNA in 10% of samples obtained from children and 12.9% from adults with cystic fibrosis. Conclusion. Our results indicate the need for continuous monitoring of the lung microflora in patients with CF, including testing for viruses.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>смешанные инфекции</kwd><kwd>муковисцидоз</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>mixed infections</kwd><kwd>cystic fibrosis</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Статья опубликована при поддержке компании ФОРМЕД.</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The article was posted with the support of FORMED.</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mashburn L.M., Jett A.M., Akins D.R., Whiteley M. Staphylococcus aureus serves as an iron source for Pseudomonas aeruginosa during in vivo coculture. J. Bacteriol. 2005; 187 (2): 554–566. DOI: 10.1128/JB.187.2.554-566.2005.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mashburn L.M., Jett A.M., Akins D.R., Whiteley M. Staphylococcus aureus serves as an iron source for Pseudomonas aeruginosa during in vivo coculture. J. Bacteriol. 2005; 187 (2): 554–566. DOI: 10.1128/JB.187.2.554-566.2005.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mitchell G., Séguin D.L., Asselin A.E. et al. Staphylococcus aureus sigma B-dependent emergence of small-colony variants and biofilm production following exposure to Pseudomonas aeruginosa 4-hydroxy-2-heptylquinoline-N-oxide. BMC Microbiol. 2010; 10: 33. DOI: 10.1186/1471-2180-10-33.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mitchell G., Séguin D.L., Asselin A.E. et al. Staphylococcus aureus sigma B-dependent emergence of small-colony variants and biofilm production following exposure to Pseudomonas aeruginosa 4-hydroxy-2-heptylquinoline-N-oxide. BMC Microbiol. 2010; 10: 33. DOI: 10.1186/1471-2180-10-33.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Doing G., Koeppen K., Occipinti P. et al. Conditional antagonism in co-cultures of Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans: An intersection of ethanol and phosphate signaling distilled from dual-seq transcriptomics. PLoS Genet. 2020; 16 (8): e1008783. DOI: 10.1371/journal.pgen.1008783.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Doing G., Koeppen K., Occipinti P. et al. Conditional antagonism in co-cultures of Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans: An intersection of ethanol and phosphate signaling distilled from dual-seq transcriptomics. PLoS Genet. 2020; 16 (8): e1008783. DOI: 10.1371/journal.pgen.1008783.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Аветисян Л.Р., Чернуха М.Ю., Шагинян И.А. и др. Применение современных методов в микробиологической диагностике хронической инфекции легких у больных муковисцидозом. Сибирское медицинское обозрение. 2019; (2): 70–79. Доступно на: https://smr.krasgmu.ru/journal/1901_8_avetisyan.pdf</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Avetisyan L.R., Chernukha M.Yu., Shaginyan I.A. et al. [Application of modern methods in microbiological diagnosis of chronic infection of lungs in patients with cystic fibrosis]. Sibirskoe meditsinskoe obozrenie. 2019; (2): 70–79. Available at: https://smr.krasgmu.ru/journal/1901_8_avetisyan.pdf (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Домонова Э.А., Творогова М.Г., Подколзин А.Т. и др. Взятие, транспортировка, хранение биологического материала для ПЦР-диагностики: методические рекомендации. М.; 2021. Доступно на: https://prepcr.crie.ru/docs/Metodicheskie_Rekomendacii.pdf</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Domonova E.A., Tvorogova M.G., Podkolzin A.T. et al. [Collection, transportation, storage of biological material for PCR diagnostics: guidelines]. Moscow; 2021. Available at: https://prepcr.crie.ru/docs/Metodicheskie_Rekomendacii.pdf (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Чернуха М.Ю., Аветисян Л.Р., Шагинян И.А. и др. Алгоритм микробиологической диагностики хронической инфекции легких у больных муковисцидозом. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014; 16 (4): 312–316. Доступно на: https://cyberleninka.ru/article/n/algoritm-mikrobiologicheskoy-diagnostiki-hronicheskoy-infektsii-lyogkih-u-bolnyh-mukovistsidozom?ysclid=lionrjfsdc41788035</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chernukha M.Yu., Avetisyan L.R., Shaginyan I.A. et al. [Microbiological diagnosis algorithm for cronic lung infection in patients with cystic fibrosis]. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2014; 16 (4): 312–316. Available at: https://cyberleninka.ru/article/n/algoritm-mikrobiologicheskoy-diagnostiki-hronicheskoy-infektsii-lyogkih-u-bolnyh-mukovistsidozom?ysclid=lionrjfsdc41788035 [Accessed: March 28, 2023] (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hotterbeekx A., Kumar-Singh S., Goossens H., Malhotra-Kumar S. In vivo and In vitro Interactions between Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus spp. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2017; 7: 106. DOI: 10.3389/fcimb.2017.00106.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hotterbeekx A., Kumar-Singh S., Goossens H., Malhotra-Kumar S. In vivo and In vitro Interactions between Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus spp. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2017; 7: 106. DOI: 10.3389/fcimb.2017.00106.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Чернуха М.Ю., Шагинян И.А., Капранов Н.И. и др. Персистенция Burkholderia cepacia у больных муковисцидозом. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2012; (4): 93–98. Доступно на: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13755</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chernukha M.Yu., Shaginyan I.A., Kapranov N.I. et al. [Burkholderia cepacia persistence in mucoviscidosis patients]. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii. 2012; (4): 93–98. Available at: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13755 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Salsgiver E.L., Fink A.K., Knapp E.A. et al. Changing epidemiology of the respiratory Bacteriology of patients with cystic fibrosis. Chest. 2016; 149 (2): 390–400. DOI: 10.1378/chest.15-0676.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Salsgiver E.L., Fink A.K., Knapp E.A. et al. Changing epidemiology of the respiratory Bacteriology of patients with cystic fibrosis. Chest. 2016; 149 (2): 390–400. DOI: 10.1378/chest.15-0676.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kiedrowski M.R., Gaston J.R., Kocak B.R. et al. Staphylococcus aureus biofilm growth on cystic fibrosis airway epithelial cells is enhanced during respiratory syncytial virus coinfection. mSphere. 2018; 3 (4): e00341-18. DOI: 10.1128/mSphere.00341-18.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kiedrowski M.R., Gaston J.R., Kocak B.R. et al. Staphylococcus aureus biofilm growth on cystic fibrosis airway epithelial cells is enhanced during respiratory syncytial virus coinfection. mSphere. 2018; 3 (4): e00341-18. DOI: 10.1128/mSphere.00341-18.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
